Protein–RNA interactions for Protein: P01853

T-cell receptor gamma chain C region C10.5, mousemouse

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Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01853 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01853 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01853 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01853 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P01853 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01853 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC16■□□□□ 0.15
P01853 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01853 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01853 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01853 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01853 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01853 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01853 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
P01853 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
P01853 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01853 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01853 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01853 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01853 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01853 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01853 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01853 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01853 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01853 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01853 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
P01853 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01853 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01853 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01853 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01853 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01853 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01853 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01853 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01853 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01853 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01853 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01853 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
P01853 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01853 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01853 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01853 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01853 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01853 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01853 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01853 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
P01853 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
P01853 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01853 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01853 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01853 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01853 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01853 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01853 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01853 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
P01853 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01853 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01853 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01853 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01853 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01853 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01853 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01853 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01853 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01853 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01853 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01853 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01853 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01853 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01853 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01853 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01853 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01853 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01853 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01853 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01853 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01853 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01853 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01853 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01853 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01853 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01853 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01853 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01853 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
P01853 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01853 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01853 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01853 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01853 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01853 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01853 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01853 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01853 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01853 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01853 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01853 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01853 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01853 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01853 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
P01853 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01853 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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