Protein–RNA interactions for Protein: P01790

Ig heavy chain V region M511, mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01790 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01790 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01790 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01790 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01790 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01790 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
P01790 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01790 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01790 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01790 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01790 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01790 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01790 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01790 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01790 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01790 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01790 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01790 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01790 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01790 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01790 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01790 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01790 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
P01790 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01790 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01790 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01790 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
P01790 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01790 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01790 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01790 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01790 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01790 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01790 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01790 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01790 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01790 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01790 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01790 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01790 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01790 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
P01790 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01790 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01790 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01790 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01790 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01790 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01790 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01790 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01790 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01790 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
P01790 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01790 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01790 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
P01790 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01790 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01790 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
P01790 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01790 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01790 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01790 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01790 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01790 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01790 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01790 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01790 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01790 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01790 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01790 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01790 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01790 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01790 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
P01790 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
P01790 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
P01790 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
P01790 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01790 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
P01790 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
P01790 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01790 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01790 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01790 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01790 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01790 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01790 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01790 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01790 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01790 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01790 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01790 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01790 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01790 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01790 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01790 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01790 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01790 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01790 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01790 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01790 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01790 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms