Protein–RNA interactions for Protein: P01789

Ig heavy chain V region M603, mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01789 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01789 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01789 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01789 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01789 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01789 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
P01789 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01789 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01789 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01789 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01789 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01789 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01789 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01789 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01789 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01789 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01789 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01789 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01789 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01789 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01789 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01789 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01789 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01789 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01789 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01789 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01789 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01789 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01789 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01789 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01789 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01789 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01789 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01789 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01789 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01789 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01789 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01789 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01789 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01789 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01789 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01789 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01789 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01789 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01789 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01789 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01789 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01789 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01789 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01789 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01789 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01789 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
P01789 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01789 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01789 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01789 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01789 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01789 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01789 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01789 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01789 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01789 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01789 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01789 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
P01789 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01789 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01789 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01789 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
P01789 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01789 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01789 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01789 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01789 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01789 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01789 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01789 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01789 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01789 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01789 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01789 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01789 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01789 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01789 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01789 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01789 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
P01789 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01789 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
P01789 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
P01789 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
P01789 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
P01789 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01789 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01789 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01789 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01789 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01789 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01789 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01789 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01789 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01789 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms