Protein–RNA interactions for Protein: P01649

Ig kappa chain V-V regions, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01649 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
P01649 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
P01649 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
P01649 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
P01649 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
P01649 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
P01649 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
P01649 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
P01649 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
P01649 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
P01649 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
P01649 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
P01649 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
P01649 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
P01649 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
P01649 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
P01649 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
P01649 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
P01649 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
P01649 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
P01649 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
P01649 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
P01649 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
P01649 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
P01649 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
P01649 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
P01649 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
P01649 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
P01649 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
P01649 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
P01649 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
P01649 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
P01649 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
P01649 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
P01649 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
P01649 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
P01649 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
P01649 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
P01649 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
P01649 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
P01649 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
P01649 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
P01649 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
P01649 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
P01649 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
P01649 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
P01649 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
P01649 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
P01649 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
P01649 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
P01649 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
P01649 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
P01649 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
P01649 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
P01649 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
P01649 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
P01649 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
P01649 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
P01649 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
P01649 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
P01649 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
P01649 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
P01649 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
P01649 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
P01649 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
P01649 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
P01649 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
P01649 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
P01649 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
P01649 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
P01649 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
P01649 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
P01649 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
P01649 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
P01649 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
P01649 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
P01649 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
P01649 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
P01649 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
P01649 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
P01649 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
P01649 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
P01649 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
P01649 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
P01649 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
P01649 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
P01649 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
P01649 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
P01649 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
P01649 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
P01649 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
P01649 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
P01649 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
P01649 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
P01649 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
P01649 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
P01649 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
P01649 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
P01649 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
P01649 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms