Protein–RNA interactions for Protein: P01193

Pomc, Pro-opiomelanocortin, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PomcP01193 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PomcP01193 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PomcP01193 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PomcP01193 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PomcP01193 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PomcP01193 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PomcP01193 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PomcP01193 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PomcP01193 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PomcP01193 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PomcP01193 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PomcP01193 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PomcP01193 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PomcP01193 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PomcP01193 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PomcP01193 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PomcP01193 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PomcP01193 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PomcP01193 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PomcP01193 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PomcP01193 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PomcP01193 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PomcP01193 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PomcP01193 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PomcP01193 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PomcP01193 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PomcP01193 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PomcP01193 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PomcP01193 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PomcP01193 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PomcP01193 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PomcP01193 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PomcP01193 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PomcP01193 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PomcP01193 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PomcP01193 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PomcP01193 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PomcP01193 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PomcP01193 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PomcP01193 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PomcP01193 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PomcP01193 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PomcP01193 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PomcP01193 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PomcP01193 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PomcP01193 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PomcP01193 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PomcP01193 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PomcP01193 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PomcP01193 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PomcP01193 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PomcP01193 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PomcP01193 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PomcP01193 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PomcP01193 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PomcP01193 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PomcP01193 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PomcP01193 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PomcP01193 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PomcP01193 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PomcP01193 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PomcP01193 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PomcP01193 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PomcP01193 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PomcP01193 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PomcP01193 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PomcP01193 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PomcP01193 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PomcP01193 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PomcP01193 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PomcP01193 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PomcP01193 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PomcP01193 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PomcP01193 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PomcP01193 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PomcP01193 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PomcP01193 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PomcP01193 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PomcP01193 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PomcP01193 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PomcP01193 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PomcP01193 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PomcP01193 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PomcP01193 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PomcP01193 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PomcP01193 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PomcP01193 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PomcP01193 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PomcP01193 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PomcP01193 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PomcP01193 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PomcP01193 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PomcP01193 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PomcP01193 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PomcP01193 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PomcP01193 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PomcP01193 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PomcP01193 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PomcP01193 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PomcP01193 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms