Protein–RNA interactions for Protein: O89116

Vti1a, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1A, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vti1aO89116 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vti1aO89116 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vti1aO89116 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Vti1aO89116 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vti1aO89116 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vti1aO89116 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vti1aO89116 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vti1aO89116 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vti1aO89116 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vti1aO89116 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vti1aO89116 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vti1aO89116 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vti1aO89116 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vti1aO89116 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vti1aO89116 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vti1aO89116 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vti1aO89116 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vti1aO89116 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vti1aO89116 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Vti1aO89116 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Vti1aO89116 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Vti1aO89116 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Vti1aO89116 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vti1aO89116 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vti1aO89116 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vti1aO89116 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vti1aO89116 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vti1aO89116 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vti1aO89116 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vti1aO89116 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vti1aO89116 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vti1aO89116 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vti1aO89116 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vti1aO89116 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vti1aO89116 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vti1aO89116 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vti1aO89116 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vti1aO89116 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vti1aO89116 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vti1aO89116 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vti1aO89116 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Vti1aO89116 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vti1aO89116 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vti1aO89116 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vti1aO89116 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vti1aO89116 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vti1aO89116 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vti1aO89116 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vti1aO89116 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vti1aO89116 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vti1aO89116 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vti1aO89116 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vti1aO89116 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vti1aO89116 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vti1aO89116 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vti1aO89116 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Vti1aO89116 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Vti1aO89116 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Vti1aO89116 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Vti1aO89116 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Vti1aO89116 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Vti1aO89116 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vti1aO89116 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vti1aO89116 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vti1aO89116 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vti1aO89116 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vti1aO89116 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vti1aO89116 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Vti1aO89116 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vti1aO89116 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vti1aO89116 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vti1aO89116 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vti1aO89116 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vti1aO89116 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vti1aO89116 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vti1aO89116 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Vti1aO89116 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vti1aO89116 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vti1aO89116 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vti1aO89116 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vti1aO89116 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vti1aO89116 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vti1aO89116 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vti1aO89116 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vti1aO89116 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vti1aO89116 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vti1aO89116 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vti1aO89116 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vti1aO89116 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vti1aO89116 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Vti1aO89116 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vti1aO89116 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vti1aO89116 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vti1aO89116 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vti1aO89116 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vti1aO89116 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vti1aO89116 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vti1aO89116 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vti1aO89116 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vti1aO89116 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms