Protein–RNA interactions for Protein: O89032

Sh3pxd2a, SH3 and PX domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 1,124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3pxd2aO89032 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sh3pxd2aO89032 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sh3pxd2aO89032 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sh3pxd2aO89032 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sh3pxd2aO89032 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sh3pxd2aO89032 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sh3pxd2aO89032 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sh3pxd2aO89032 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sh3pxd2aO89032 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sh3pxd2aO89032 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sh3pxd2aO89032 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sh3pxd2aO89032 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Sh3pxd2aO89032 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sh3pxd2aO89032 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sh3pxd2aO89032 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sh3pxd2aO89032 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Sh3pxd2aO89032 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sh3pxd2aO89032 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Sh3pxd2aO89032 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sh3pxd2aO89032 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sh3pxd2aO89032 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sh3pxd2aO89032 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sh3pxd2aO89032 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Sh3pxd2aO89032 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sh3pxd2aO89032 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sh3pxd2aO89032 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sh3pxd2aO89032 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sh3pxd2aO89032 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sh3pxd2aO89032 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Sh3pxd2aO89032 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sh3pxd2aO89032 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sh3pxd2aO89032 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sh3pxd2aO89032 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sh3pxd2aO89032 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sh3pxd2aO89032 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sh3pxd2aO89032 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sh3pxd2aO89032 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sh3pxd2aO89032 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sh3pxd2aO89032 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sh3pxd2aO89032 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sh3pxd2aO89032 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sh3pxd2aO89032 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sh3pxd2aO89032 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Sh3pxd2aO89032 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sh3pxd2aO89032 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sh3pxd2aO89032 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sh3pxd2aO89032 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sh3pxd2aO89032 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sh3pxd2aO89032 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sh3pxd2aO89032 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sh3pxd2aO89032 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sh3pxd2aO89032 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sh3pxd2aO89032 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sh3pxd2aO89032 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sh3pxd2aO89032 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sh3pxd2aO89032 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sh3pxd2aO89032 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sh3pxd2aO89032 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sh3pxd2aO89032 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sh3pxd2aO89032 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sh3pxd2aO89032 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sh3pxd2aO89032 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sh3pxd2aO89032 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sh3pxd2aO89032 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sh3pxd2aO89032 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sh3pxd2aO89032 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sh3pxd2aO89032 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sh3pxd2aO89032 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sh3pxd2aO89032 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sh3pxd2aO89032 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sh3pxd2aO89032 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sh3pxd2aO89032 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sh3pxd2aO89032 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sh3pxd2aO89032 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Sh3pxd2aO89032 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sh3pxd2aO89032 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sh3pxd2aO89032 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sh3pxd2aO89032 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sh3pxd2aO89032 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sh3pxd2aO89032 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sh3pxd2aO89032 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sh3pxd2aO89032 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sh3pxd2aO89032 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sh3pxd2aO89032 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sh3pxd2aO89032 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sh3pxd2aO89032 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sh3pxd2aO89032 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sh3pxd2aO89032 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sh3pxd2aO89032 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sh3pxd2aO89032 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sh3pxd2aO89032 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sh3pxd2aO89032 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sh3pxd2aO89032 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sh3pxd2aO89032 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sh3pxd2aO89032 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sh3pxd2aO89032 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sh3pxd2aO89032 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sh3pxd2aO89032 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sh3pxd2aO89032 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sh3pxd2aO89032 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms