Protein–RNA interactions for Protein: O88188

Ly86, Lymphocyte antigen 86, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly86O88188 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ly86O88188 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ly86O88188 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ly86O88188 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ly86O88188 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ly86O88188 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ly86O88188 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ly86O88188 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ly86O88188 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ly86O88188 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ly86O88188 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ly86O88188 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ly86O88188 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ly86O88188 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ly86O88188 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ly86O88188 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ly86O88188 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ly86O88188 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ly86O88188 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ly86O88188 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ly86O88188 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ly86O88188 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ly86O88188 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ly86O88188 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ly86O88188 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ly86O88188 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ly86O88188 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ly86O88188 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ly86O88188 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ly86O88188 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ly86O88188 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ly86O88188 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ly86O88188 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ly86O88188 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ly86O88188 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ly86O88188 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ly86O88188 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ly86O88188 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ly86O88188 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ly86O88188 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ly86O88188 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ly86O88188 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ly86O88188 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ly86O88188 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ly86O88188 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ly86O88188 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ly86O88188 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ly86O88188 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ly86O88188 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ly86O88188 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ly86O88188 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ly86O88188 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ly86O88188 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ly86O88188 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ly86O88188 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ly86O88188 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ly86O88188 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ly86O88188 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ly86O88188 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ly86O88188 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ly86O88188 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ly86O88188 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ly86O88188 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ly86O88188 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ly86O88188 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ly86O88188 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ly86O88188 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ly86O88188 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ly86O88188 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ly86O88188 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ly86O88188 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ly86O88188 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ly86O88188 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ly86O88188 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ly86O88188 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ly86O88188 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ly86O88188 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ly86O88188 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ly86O88188 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ly86O88188 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ly86O88188 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ly86O88188 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ly86O88188 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ly86O88188 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ly86O88188 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ly86O88188 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ly86O88188 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ly86O88188 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ly86O88188 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ly86O88188 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ly86O88188 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ly86O88188 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ly86O88188 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ly86O88188 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ly86O88188 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ly86O88188 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ly86O88188 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ly86O88188 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ly86O88188 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ly86O88188 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms