Protein–RNA interactions for Protein: O70340

Nptx2, Neuronal pentraxin-2, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nptx2O70340 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nptx2O70340 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nptx2O70340 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nptx2O70340 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nptx2O70340 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nptx2O70340 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Nptx2O70340 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nptx2O70340 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nptx2O70340 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nptx2O70340 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nptx2O70340 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nptx2O70340 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nptx2O70340 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nptx2O70340 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nptx2O70340 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nptx2O70340 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Nptx2O70340 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nptx2O70340 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nptx2O70340 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nptx2O70340 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Nptx2O70340 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nptx2O70340 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nptx2O70340 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nptx2O70340 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Nptx2O70340 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nptx2O70340 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nptx2O70340 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nptx2O70340 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nptx2O70340 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nptx2O70340 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nptx2O70340 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nptx2O70340 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nptx2O70340 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nptx2O70340 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Nptx2O70340 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nptx2O70340 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nptx2O70340 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Nptx2O70340 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Nptx2O70340 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
Nptx2O70340 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Nptx2O70340 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Nptx2O70340 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nptx2O70340 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Nptx2O70340 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nptx2O70340 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nptx2O70340 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nptx2O70340 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nptx2O70340 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nptx2O70340 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nptx2O70340 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nptx2O70340 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nptx2O70340 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nptx2O70340 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nptx2O70340 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nptx2O70340 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nptx2O70340 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nptx2O70340 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nptx2O70340 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nptx2O70340 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nptx2O70340 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nptx2O70340 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nptx2O70340 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nptx2O70340 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nptx2O70340 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nptx2O70340 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nptx2O70340 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nptx2O70340 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nptx2O70340 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nptx2O70340 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nptx2O70340 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nptx2O70340 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nptx2O70340 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nptx2O70340 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nptx2O70340 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nptx2O70340 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nptx2O70340 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nptx2O70340 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nptx2O70340 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nptx2O70340 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nptx2O70340 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Nptx2O70340 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nptx2O70340 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nptx2O70340 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nptx2O70340 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nptx2O70340 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nptx2O70340 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nptx2O70340 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nptx2O70340 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nptx2O70340 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nptx2O70340 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nptx2O70340 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nptx2O70340 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nptx2O70340 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nptx2O70340 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nptx2O70340 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nptx2O70340 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nptx2O70340 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nptx2O70340 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nptx2O70340 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Nptx2O70340 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms