Protein–RNA interactions for Protein: O70174

Chrna4, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna4O70174 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Chrna4O70174 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Chrna4O70174 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Chrna4O70174 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Chrna4O70174 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Chrna4O70174 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Chrna4O70174 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Chrna4O70174 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Chrna4O70174 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Chrna4O70174 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Chrna4O70174 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Chrna4O70174 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Chrna4O70174 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Chrna4O70174 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Chrna4O70174 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Chrna4O70174 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Chrna4O70174 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Chrna4O70174 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Chrna4O70174 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Chrna4O70174 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Chrna4O70174 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Chrna4O70174 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Chrna4O70174 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Chrna4O70174 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Chrna4O70174 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Chrna4O70174 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Chrna4O70174 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Chrna4O70174 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Chrna4O70174 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chrna4O70174 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chrna4O70174 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chrna4O70174 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chrna4O70174 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chrna4O70174 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chrna4O70174 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Chrna4O70174 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Chrna4O70174 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Chrna4O70174 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Chrna4O70174 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Chrna4O70174 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Chrna4O70174 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Chrna4O70174 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Chrna4O70174 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Chrna4O70174 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Chrna4O70174 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Chrna4O70174 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Chrna4O70174 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Chrna4O70174 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Chrna4O70174 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Chrna4O70174 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Chrna4O70174 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Chrna4O70174 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Chrna4O70174 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Chrna4O70174 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Chrna4O70174 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Chrna4O70174 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Chrna4O70174 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Chrna4O70174 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Chrna4O70174 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Chrna4O70174 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Chrna4O70174 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Chrna4O70174 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Chrna4O70174 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Chrna4O70174 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Chrna4O70174 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Chrna4O70174 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Chrna4O70174 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Chrna4O70174 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Chrna4O70174 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Chrna4O70174 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Chrna4O70174 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Chrna4O70174 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Chrna4O70174 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Chrna4O70174 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Chrna4O70174 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Chrna4O70174 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Chrna4O70174 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Chrna4O70174 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Chrna4O70174 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Chrna4O70174 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Chrna4O70174 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Chrna4O70174 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Chrna4O70174 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Chrna4O70174 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Chrna4O70174 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Chrna4O70174 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Chrna4O70174 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Chrna4O70174 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Chrna4O70174 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Chrna4O70174 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Chrna4O70174 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Chrna4O70174 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Chrna4O70174 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Chrna4O70174 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Chrna4O70174 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Chrna4O70174 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Chrna4O70174 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Chrna4O70174 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Chrna4O70174 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Chrna4O70174 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 142.5 ms