Protein–RNA interactions for Protein: O55237

Cd70, CD70 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd70O55237 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cd70O55237 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cd70O55237 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cd70O55237 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cd70O55237 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cd70O55237 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cd70O55237 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cd70O55237 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cd70O55237 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cd70O55237 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cd70O55237 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cd70O55237 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cd70O55237 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cd70O55237 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cd70O55237 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cd70O55237 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cd70O55237 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cd70O55237 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cd70O55237 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cd70O55237 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cd70O55237 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cd70O55237 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cd70O55237 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cd70O55237 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cd70O55237 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cd70O55237 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cd70O55237 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cd70O55237 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cd70O55237 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cd70O55237 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cd70O55237 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cd70O55237 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cd70O55237 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cd70O55237 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cd70O55237 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cd70O55237 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cd70O55237 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cd70O55237 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cd70O55237 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cd70O55237 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cd70O55237 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cd70O55237 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cd70O55237 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cd70O55237 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cd70O55237 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Cd70O55237 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cd70O55237 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cd70O55237 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cd70O55237 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cd70O55237 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cd70O55237 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cd70O55237 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cd70O55237 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cd70O55237 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cd70O55237 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cd70O55237 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cd70O55237 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cd70O55237 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cd70O55237 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cd70O55237 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cd70O55237 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cd70O55237 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cd70O55237 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cd70O55237 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cd70O55237 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cd70O55237 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cd70O55237 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cd70O55237 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cd70O55237 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cd70O55237 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cd70O55237 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cd70O55237 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cd70O55237 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cd70O55237 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cd70O55237 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cd70O55237 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cd70O55237 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cd70O55237 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cd70O55237 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cd70O55237 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Cd70O55237 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cd70O55237 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cd70O55237 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cd70O55237 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cd70O55237 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cd70O55237 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cd70O55237 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Cd70O55237 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cd70O55237 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cd70O55237 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cd70O55237 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cd70O55237 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cd70O55237 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cd70O55237 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cd70O55237 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cd70O55237 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cd70O55237 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Cd70O55237 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cd70O55237 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cd70O55237 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms