Protein–RNA interactions for Protein: O55226

Chad, Chondroadherin, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChadO55226 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ChadO55226 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ChadO55226 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ChadO55226 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ChadO55226 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ChadO55226 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ChadO55226 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ChadO55226 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ChadO55226 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ChadO55226 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ChadO55226 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ChadO55226 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.28■■□□□ 1
ChadO55226 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ChadO55226 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ChadO55226 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ChadO55226 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ChadO55226 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ChadO55226 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ChadO55226 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ChadO55226 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ChadO55226 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ChadO55226 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ChadO55226 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ChadO55226 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ChadO55226 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ChadO55226 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ChadO55226 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ChadO55226 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ChadO55226 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ChadO55226 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ChadO55226 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ChadO55226 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ChadO55226 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ChadO55226 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ChadO55226 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ChadO55226 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ChadO55226 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ChadO55226 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ChadO55226 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ChadO55226 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ChadO55226 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ChadO55226 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ChadO55226 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ChadO55226 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ChadO55226 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ChadO55226 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ChadO55226 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ChadO55226 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ChadO55226 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ChadO55226 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ChadO55226 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ChadO55226 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ChadO55226 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ChadO55226 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ChadO55226 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ChadO55226 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ChadO55226 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ChadO55226 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ChadO55226 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ChadO55226 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ChadO55226 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ChadO55226 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ChadO55226 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ChadO55226 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ChadO55226 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ChadO55226 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ChadO55226 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ChadO55226 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ChadO55226 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ChadO55226 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ChadO55226 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ChadO55226 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ChadO55226 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ChadO55226 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ChadO55226 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ChadO55226 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ChadO55226 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ChadO55226 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ChadO55226 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ChadO55226 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ChadO55226 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ChadO55226 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ChadO55226 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ChadO55226 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ChadO55226 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ChadO55226 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ChadO55226 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ChadO55226 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ChadO55226 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ChadO55226 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ChadO55226 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ChadO55226 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ChadO55226 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ChadO55226 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ChadO55226 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ChadO55226 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ChadO55226 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ChadO55226 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ChadO55226 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ChadO55226 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms