Protein–RNA interactions for Protein: O54990

Prom1, Prominin-1, mousemouse

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prom1O54990 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prom1O54990 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prom1O54990 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prom1O54990 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prom1O54990 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prom1O54990 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prom1O54990 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prom1O54990 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prom1O54990 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prom1O54990 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prom1O54990 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prom1O54990 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prom1O54990 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prom1O54990 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prom1O54990 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prom1O54990 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prom1O54990 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prom1O54990 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prom1O54990 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Prom1O54990 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prom1O54990 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prom1O54990 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prom1O54990 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prom1O54990 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prom1O54990 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prom1O54990 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prom1O54990 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prom1O54990 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prom1O54990 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prom1O54990 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prom1O54990 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prom1O54990 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prom1O54990 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prom1O54990 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prom1O54990 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prom1O54990 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prom1O54990 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prom1O54990 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prom1O54990 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prom1O54990 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Prom1O54990 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prom1O54990 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prom1O54990 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prom1O54990 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prom1O54990 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prom1O54990 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prom1O54990 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prom1O54990 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prom1O54990 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prom1O54990 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prom1O54990 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prom1O54990 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prom1O54990 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Prom1O54990 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prom1O54990 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prom1O54990 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prom1O54990 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prom1O54990 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Prom1O54990 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Prom1O54990 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Prom1O54990 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Prom1O54990 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Prom1O54990 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Prom1O54990 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Prom1O54990 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Prom1O54990 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prom1O54990 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prom1O54990 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prom1O54990 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prom1O54990 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prom1O54990 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Prom1O54990 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prom1O54990 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prom1O54990 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prom1O54990 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prom1O54990 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Prom1O54990 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prom1O54990 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prom1O54990 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prom1O54990 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prom1O54990 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prom1O54990 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prom1O54990 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prom1O54990 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prom1O54990 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prom1O54990 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Prom1O54990 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prom1O54990 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prom1O54990 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prom1O54990 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prom1O54990 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prom1O54990 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prom1O54990 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prom1O54990 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prom1O54990 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prom1O54990 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Prom1O54990 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prom1O54990 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prom1O54990 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prom1O54990 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms