Protein–RNA interactions for Protein: O54946

Dnajb6, DnaJ homolog subfamily B member 6, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajb6O54946 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Dnajb6O54946 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Dnajb6O54946 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Dnajb6O54946 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Dnajb6O54946 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Dnajb6O54946 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Dnajb6O54946 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Dnajb6O54946 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Dnajb6O54946 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Dnajb6O54946 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Dnajb6O54946 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Dnajb6O54946 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Dnajb6O54946 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Dnajb6O54946 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Dnajb6O54946 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Dnajb6O54946 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Dnajb6O54946 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Dnajb6O54946 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Dnajb6O54946 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Dnajb6O54946 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Dnajb6O54946 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Dnajb6O54946 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Dnajb6O54946 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Dnajb6O54946 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Dnajb6O54946 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Dnajb6O54946 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Dnajb6O54946 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Dnajb6O54946 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Dnajb6O54946 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Dnajb6O54946 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Dnajb6O54946 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Dnajb6O54946 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Dnajb6O54946 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Dnajb6O54946 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Dnajb6O54946 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Dnajb6O54946 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Dnajb6O54946 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Dnajb6O54946 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Dnajb6O54946 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Dnajb6O54946 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Dnajb6O54946 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Dnajb6O54946 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Dnajb6O54946 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Dnajb6O54946 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Dnajb6O54946 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Dnajb6O54946 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Dnajb6O54946 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Dnajb6O54946 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Dnajb6O54946 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Dnajb6O54946 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Dnajb6O54946 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Dnajb6O54946 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Dnajb6O54946 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Dnajb6O54946 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Dnajb6O54946 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Dnajb6O54946 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Dnajb6O54946 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Dnajb6O54946 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Dnajb6O54946 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Dnajb6O54946 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Dnajb6O54946 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Dnajb6O54946 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Dnajb6O54946 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Dnajb6O54946 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Dnajb6O54946 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Dnajb6O54946 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Dnajb6O54946 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Dnajb6O54946 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Dnajb6O54946 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Dnajb6O54946 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Dnajb6O54946 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Dnajb6O54946 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Dnajb6O54946 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Dnajb6O54946 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Dnajb6O54946 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Dnajb6O54946 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Dnajb6O54946 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Dnajb6O54946 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Dnajb6O54946 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Dnajb6O54946 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Dnajb6O54946 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Dnajb6O54946 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Dnajb6O54946 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Dnajb6O54946 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Dnajb6O54946 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Dnajb6O54946 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Dnajb6O54946 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Dnajb6O54946 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Dnajb6O54946 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Dnajb6O54946 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Dnajb6O54946 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Dnajb6O54946 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Dnajb6O54946 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Dnajb6O54946 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Dnajb6O54946 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Dnajb6O54946 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Dnajb6O54946 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Dnajb6O54946 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Dnajb6O54946 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Dnajb6O54946 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms