Protein–RNA interactions for Protein: O54890

Itgb3, Integrin beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb3O54890 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Itgb3O54890 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Itgb3O54890 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Itgb3O54890 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Itgb3O54890 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Itgb3O54890 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Itgb3O54890 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Itgb3O54890 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Itgb3O54890 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Itgb3O54890 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Itgb3O54890 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Itgb3O54890 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Itgb3O54890 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Itgb3O54890 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Itgb3O54890 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Itgb3O54890 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Itgb3O54890 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Itgb3O54890 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Itgb3O54890 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Itgb3O54890 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Itgb3O54890 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Itgb3O54890 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Itgb3O54890 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Itgb3O54890 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Itgb3O54890 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Itgb3O54890 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Itgb3O54890 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Itgb3O54890 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Itgb3O54890 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Itgb3O54890 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Itgb3O54890 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Itgb3O54890 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Itgb3O54890 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Itgb3O54890 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Itgb3O54890 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Itgb3O54890 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Itgb3O54890 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Itgb3O54890 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Itgb3O54890 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Itgb3O54890 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Itgb3O54890 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Itgb3O54890 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Itgb3O54890 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Itgb3O54890 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Itgb3O54890 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Itgb3O54890 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Itgb3O54890 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Itgb3O54890 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Itgb3O54890 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Itgb3O54890 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Itgb3O54890 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Itgb3O54890 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Itgb3O54890 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Itgb3O54890 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Itgb3O54890 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Itgb3O54890 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Itgb3O54890 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Itgb3O54890 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Itgb3O54890 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Itgb3O54890 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Itgb3O54890 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Itgb3O54890 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Itgb3O54890 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Itgb3O54890 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Itgb3O54890 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Itgb3O54890 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Itgb3O54890 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Itgb3O54890 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Itgb3O54890 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Itgb3O54890 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Itgb3O54890 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Itgb3O54890 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Itgb3O54890 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Itgb3O54890 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Itgb3O54890 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Itgb3O54890 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Itgb3O54890 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Itgb3O54890 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Itgb3O54890 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Itgb3O54890 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Itgb3O54890 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Itgb3O54890 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Itgb3O54890 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Itgb3O54890 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Itgb3O54890 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Itgb3O54890 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Itgb3O54890 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Itgb3O54890 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Itgb3O54890 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Itgb3O54890 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Itgb3O54890 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Itgb3O54890 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Itgb3O54890 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Itgb3O54890 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Itgb3O54890 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Itgb3O54890 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Itgb3O54890 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Itgb3O54890 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Itgb3O54890 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Itgb3O54890 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms