Protein–RNA interactions for Protein: O35904

Pik3cd, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit delta isoform, mousemouse

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3cdO35904 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pik3cdO35904 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pik3cdO35904 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pik3cdO35904 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pik3cdO35904 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pik3cdO35904 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Pik3cdO35904 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Pik3cdO35904 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pik3cdO35904 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pik3cdO35904 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pik3cdO35904 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pik3cdO35904 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pik3cdO35904 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pik3cdO35904 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pik3cdO35904 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pik3cdO35904 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pik3cdO35904 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pik3cdO35904 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pik3cdO35904 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pik3cdO35904 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pik3cdO35904 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pik3cdO35904 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pik3cdO35904 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pik3cdO35904 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pik3cdO35904 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pik3cdO35904 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Pik3cdO35904 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pik3cdO35904 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Pik3cdO35904 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Pik3cdO35904 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Pik3cdO35904 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Pik3cdO35904 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pik3cdO35904 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pik3cdO35904 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Pik3cdO35904 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pik3cdO35904 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Pik3cdO35904 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pik3cdO35904 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Pik3cdO35904 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pik3cdO35904 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pik3cdO35904 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pik3cdO35904 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pik3cdO35904 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pik3cdO35904 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Pik3cdO35904 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pik3cdO35904 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pik3cdO35904 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pik3cdO35904 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Pik3cdO35904 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pik3cdO35904 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Pik3cdO35904 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pik3cdO35904 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pik3cdO35904 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Pik3cdO35904 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Pik3cdO35904 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pik3cdO35904 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pik3cdO35904 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pik3cdO35904 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pik3cdO35904 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pik3cdO35904 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pik3cdO35904 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pik3cdO35904 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pik3cdO35904 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Pik3cdO35904 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Pik3cdO35904 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pik3cdO35904 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pik3cdO35904 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pik3cdO35904 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pik3cdO35904 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Pik3cdO35904 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pik3cdO35904 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pik3cdO35904 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pik3cdO35904 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Pik3cdO35904 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pik3cdO35904 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pik3cdO35904 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pik3cdO35904 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Pik3cdO35904 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pik3cdO35904 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pik3cdO35904 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pik3cdO35904 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pik3cdO35904 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pik3cdO35904 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pik3cdO35904 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pik3cdO35904 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pik3cdO35904 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pik3cdO35904 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pik3cdO35904 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pik3cdO35904 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pik3cdO35904 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pik3cdO35904 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pik3cdO35904 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pik3cdO35904 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pik3cdO35904 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pik3cdO35904 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pik3cdO35904 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pik3cdO35904 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pik3cdO35904 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pik3cdO35904 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pik3cdO35904 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms