Protein–RNA interactions for Protein: O35864

Cops5, COP9 signalosome complex subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops5O35864 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cops5O35864 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cops5O35864 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Cops5O35864 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cops5O35864 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cops5O35864 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cops5O35864 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cops5O35864 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cops5O35864 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cops5O35864 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cops5O35864 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cops5O35864 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cops5O35864 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cops5O35864 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cops5O35864 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cops5O35864 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cops5O35864 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cops5O35864 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cops5O35864 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cops5O35864 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cops5O35864 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cops5O35864 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cops5O35864 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cops5O35864 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cops5O35864 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cops5O35864 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cops5O35864 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cops5O35864 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cops5O35864 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cops5O35864 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cops5O35864 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cops5O35864 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cops5O35864 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cops5O35864 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cops5O35864 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cops5O35864 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Cops5O35864 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cops5O35864 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cops5O35864 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cops5O35864 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cops5O35864 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cops5O35864 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cops5O35864 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cops5O35864 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cops5O35864 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cops5O35864 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cops5O35864 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cops5O35864 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cops5O35864 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cops5O35864 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cops5O35864 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cops5O35864 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Cops5O35864 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cops5O35864 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cops5O35864 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cops5O35864 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cops5O35864 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cops5O35864 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cops5O35864 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cops5O35864 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cops5O35864 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cops5O35864 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cops5O35864 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cops5O35864 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cops5O35864 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cops5O35864 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Cops5O35864 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cops5O35864 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cops5O35864 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cops5O35864 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cops5O35864 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cops5O35864 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cops5O35864 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cops5O35864 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cops5O35864 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cops5O35864 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cops5O35864 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cops5O35864 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cops5O35864 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cops5O35864 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cops5O35864 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cops5O35864 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cops5O35864 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Cops5O35864 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cops5O35864 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cops5O35864 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cops5O35864 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cops5O35864 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cops5O35864 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cops5O35864 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Cops5O35864 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cops5O35864 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cops5O35864 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cops5O35864 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cops5O35864 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cops5O35864 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cops5O35864 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cops5O35864 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cops5O35864 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cops5O35864 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms