Protein–RNA interactions for Protein: O35685

Nudc, Nuclear migration protein nudC, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NudcO35685 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NudcO35685 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NudcO35685 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NudcO35685 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NudcO35685 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NudcO35685 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NudcO35685 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NudcO35685 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NudcO35685 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NudcO35685 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NudcO35685 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NudcO35685 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.96
NudcO35685 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NudcO35685 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
NudcO35685 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NudcO35685 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
NudcO35685 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NudcO35685 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NudcO35685 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NudcO35685 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
NudcO35685 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NudcO35685 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NudcO35685 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NudcO35685 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NudcO35685 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NudcO35685 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NudcO35685 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NudcO35685 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NudcO35685 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NudcO35685 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NudcO35685 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NudcO35685 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NudcO35685 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NudcO35685 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NudcO35685 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NudcO35685 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NudcO35685 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NudcO35685 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NudcO35685 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NudcO35685 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NudcO35685 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NudcO35685 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NudcO35685 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NudcO35685 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NudcO35685 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NudcO35685 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NudcO35685 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NudcO35685 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NudcO35685 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NudcO35685 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NudcO35685 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
NudcO35685 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NudcO35685 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NudcO35685 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NudcO35685 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NudcO35685 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NudcO35685 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
NudcO35685 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NudcO35685 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NudcO35685 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NudcO35685 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NudcO35685 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NudcO35685 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NudcO35685 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
NudcO35685 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NudcO35685 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
NudcO35685 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NudcO35685 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NudcO35685 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NudcO35685 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
NudcO35685 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NudcO35685 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NudcO35685 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NudcO35685 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NudcO35685 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NudcO35685 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NudcO35685 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NudcO35685 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
NudcO35685 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NudcO35685 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NudcO35685 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NudcO35685 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NudcO35685 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NudcO35685 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
NudcO35685 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NudcO35685 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NudcO35685 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NudcO35685 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NudcO35685 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
NudcO35685 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NudcO35685 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NudcO35685 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NudcO35685 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NudcO35685 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NudcO35685 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NudcO35685 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
NudcO35685 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NudcO35685 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NudcO35685 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NudcO35685 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms