Protein–RNA interactions for Protein: O35602

Rax, Retinal homeobox protein Rx, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RaxO35602 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RaxO35602 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RaxO35602 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RaxO35602 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RaxO35602 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RaxO35602 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RaxO35602 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RaxO35602 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RaxO35602 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RaxO35602 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RaxO35602 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RaxO35602 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RaxO35602 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RaxO35602 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RaxO35602 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RaxO35602 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
RaxO35602 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RaxO35602 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RaxO35602 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RaxO35602 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RaxO35602 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RaxO35602 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RaxO35602 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RaxO35602 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RaxO35602 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RaxO35602 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RaxO35602 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RaxO35602 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RaxO35602 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RaxO35602 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RaxO35602 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RaxO35602 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RaxO35602 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RaxO35602 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RaxO35602 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RaxO35602 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RaxO35602 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RaxO35602 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RaxO35602 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RaxO35602 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RaxO35602 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RaxO35602 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RaxO35602 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RaxO35602 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RaxO35602 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RaxO35602 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RaxO35602 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RaxO35602 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RaxO35602 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RaxO35602 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RaxO35602 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RaxO35602 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
RaxO35602 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
RaxO35602 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RaxO35602 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RaxO35602 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RaxO35602 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RaxO35602 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RaxO35602 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RaxO35602 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RaxO35602 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RaxO35602 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RaxO35602 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RaxO35602 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RaxO35602 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RaxO35602 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RaxO35602 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RaxO35602 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RaxO35602 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RaxO35602 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RaxO35602 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RaxO35602 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RaxO35602 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RaxO35602 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RaxO35602 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RaxO35602 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RaxO35602 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RaxO35602 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RaxO35602 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RaxO35602 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RaxO35602 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RaxO35602 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RaxO35602 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RaxO35602 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RaxO35602 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RaxO35602 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RaxO35602 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RaxO35602 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RaxO35602 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RaxO35602 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RaxO35602 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RaxO35602 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RaxO35602 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RaxO35602 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RaxO35602 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RaxO35602 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RaxO35602 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RaxO35602 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RaxO35602 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RaxO35602 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms