Protein–RNA interactions for Protein: O35454

Clcn6, Chloride transport protein 6, mousemouse

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Length 870 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn6O35454 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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Clcn6O35454 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Clcn6O35454 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Clcn6O35454 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Clcn6O35454 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Clcn6O35454 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Clcn6O35454 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Clcn6O35454 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Clcn6O35454 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Clcn6O35454 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Clcn6O35454 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Clcn6O35454 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Clcn6O35454 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Clcn6O35454 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Clcn6O35454 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Clcn6O35454 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Clcn6O35454 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Clcn6O35454 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Clcn6O35454 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Clcn6O35454 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Clcn6O35454 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Clcn6O35454 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Clcn6O35454 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Clcn6O35454 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Clcn6O35454 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Clcn6O35454 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Clcn6O35454 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Clcn6O35454 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Clcn6O35454 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Clcn6O35454 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Clcn6O35454 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Clcn6O35454 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Clcn6O35454 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Clcn6O35454 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Clcn6O35454 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
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Clcn6O35454 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
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Clcn6O35454 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Clcn6O35454 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Clcn6O35454 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
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Clcn6O35454 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
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Clcn6O35454 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Clcn6O35454 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Clcn6O35454 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Clcn6O35454 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
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Clcn6O35454 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Clcn6O35454 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Clcn6O35454 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
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Clcn6O35454 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Clcn6O35454 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Clcn6O35454 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Clcn6O35454 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Clcn6O35454 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Clcn6O35454 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
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Clcn6O35454 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Clcn6O35454 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Clcn6O35454 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Clcn6O35454 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Clcn6O35454 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Clcn6O35454 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Clcn6O35454 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Clcn6O35454 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Clcn6O35454 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Clcn6O35454 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Clcn6O35454 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Clcn6O35454 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Clcn6O35454 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Clcn6O35454 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Clcn6O35454 Gm11361-201ENSMUST00000223428 607 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Clcn6O35454 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Clcn6O35454 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Clcn6O35454 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Clcn6O35454 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Clcn6O35454 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Clcn6O35454 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Clcn6O35454 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Clcn6O35454 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Clcn6O35454 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
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