Protein–RNA interactions for Protein: O35228

Ebi3, Interleukin-27 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ebi3O35228 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ebi3O35228 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ebi3O35228 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ebi3O35228 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ebi3O35228 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ebi3O35228 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ebi3O35228 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ebi3O35228 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ebi3O35228 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ebi3O35228 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ebi3O35228 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ebi3O35228 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ebi3O35228 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ebi3O35228 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ebi3O35228 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ebi3O35228 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ebi3O35228 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ebi3O35228 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ebi3O35228 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ebi3O35228 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ebi3O35228 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ebi3O35228 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ebi3O35228 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ebi3O35228 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ebi3O35228 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ebi3O35228 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ebi3O35228 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ebi3O35228 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ebi3O35228 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ebi3O35228 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ebi3O35228 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ebi3O35228 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ebi3O35228 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ebi3O35228 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ebi3O35228 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ebi3O35228 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ebi3O35228 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ebi3O35228 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ebi3O35228 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ebi3O35228 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ebi3O35228 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ebi3O35228 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ebi3O35228 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ebi3O35228 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ebi3O35228 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ebi3O35228 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ebi3O35228 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ebi3O35228 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ebi3O35228 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ebi3O35228 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ebi3O35228 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ebi3O35228 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ebi3O35228 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ebi3O35228 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ebi3O35228 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ebi3O35228 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ebi3O35228 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ebi3O35228 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ebi3O35228 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ebi3O35228 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ebi3O35228 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ebi3O35228 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ebi3O35228 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ebi3O35228 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ebi3O35228 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ebi3O35228 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ebi3O35228 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ebi3O35228 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ebi3O35228 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ebi3O35228 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ebi3O35228 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ebi3O35228 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ebi3O35228 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ebi3O35228 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ebi3O35228 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ebi3O35228 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ebi3O35228 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ebi3O35228 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ebi3O35228 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ebi3O35228 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ebi3O35228 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ebi3O35228 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ebi3O35228 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ebi3O35228 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ebi3O35228 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ebi3O35228 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ebi3O35228 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ebi3O35228 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ebi3O35228 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ebi3O35228 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ebi3O35228 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ebi3O35228 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ebi3O35228 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ebi3O35228 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ebi3O35228 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ebi3O35228 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ebi3O35228 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ebi3O35228 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ebi3O35228 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ebi3O35228 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms