Protein–RNA interactions for Protein: O35218

Cpsf2, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf2O35218 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cpsf2O35218 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cpsf2O35218 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cpsf2O35218 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cpsf2O35218 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cpsf2O35218 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cpsf2O35218 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cpsf2O35218 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cpsf2O35218 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cpsf2O35218 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cpsf2O35218 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cpsf2O35218 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cpsf2O35218 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cpsf2O35218 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cpsf2O35218 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cpsf2O35218 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cpsf2O35218 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cpsf2O35218 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cpsf2O35218 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cpsf2O35218 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cpsf2O35218 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cpsf2O35218 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cpsf2O35218 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cpsf2O35218 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cpsf2O35218 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cpsf2O35218 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cpsf2O35218 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cpsf2O35218 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cpsf2O35218 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cpsf2O35218 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cpsf2O35218 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cpsf2O35218 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cpsf2O35218 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cpsf2O35218 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cpsf2O35218 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cpsf2O35218 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cpsf2O35218 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cpsf2O35218 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cpsf2O35218 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cpsf2O35218 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cpsf2O35218 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cpsf2O35218 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cpsf2O35218 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cpsf2O35218 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cpsf2O35218 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cpsf2O35218 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cpsf2O35218 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cpsf2O35218 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cpsf2O35218 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cpsf2O35218 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cpsf2O35218 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cpsf2O35218 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cpsf2O35218 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cpsf2O35218 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cpsf2O35218 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cpsf2O35218 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cpsf2O35218 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Cpsf2O35218 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Cpsf2O35218 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cpsf2O35218 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cpsf2O35218 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cpsf2O35218 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cpsf2O35218 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Cpsf2O35218 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Cpsf2O35218 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cpsf2O35218 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cpsf2O35218 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cpsf2O35218 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cpsf2O35218 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cpsf2O35218 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Cpsf2O35218 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cpsf2O35218 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cpsf2O35218 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cpsf2O35218 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cpsf2O35218 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cpsf2O35218 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cpsf2O35218 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cpsf2O35218 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cpsf2O35218 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cpsf2O35218 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cpsf2O35218 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cpsf2O35218 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cpsf2O35218 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cpsf2O35218 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cpsf2O35218 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cpsf2O35218 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cpsf2O35218 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Cpsf2O35218 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cpsf2O35218 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cpsf2O35218 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cpsf2O35218 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cpsf2O35218 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cpsf2O35218 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cpsf2O35218 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cpsf2O35218 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cpsf2O35218 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cpsf2O35218 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cpsf2O35218 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cpsf2O35218 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cpsf2O35218 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms