Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

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Length 405 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Casq1O09165 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Casq1O09165 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Casq1O09165 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Casq1O09165 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Casq1O09165 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Casq1O09165 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Casq1O09165 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Casq1O09165 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Casq1O09165 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Casq1O09165 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Casq1O09165 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Casq1O09165 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Casq1O09165 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Casq1O09165 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Casq1O09165 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Casq1O09165 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Casq1O09165 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Casq1O09165 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Casq1O09165 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Casq1O09165 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Casq1O09165 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Casq1O09165 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Casq1O09165 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Casq1O09165 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Casq1O09165 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Casq1O09165 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Casq1O09165 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Casq1O09165 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Casq1O09165 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Casq1O09165 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Casq1O09165 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Casq1O09165 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Casq1O09165 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Casq1O09165 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Casq1O09165 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Casq1O09165 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Casq1O09165 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Casq1O09165 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Casq1O09165 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Casq1O09165 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Casq1O09165 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Casq1O09165 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Casq1O09165 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Casq1O09165 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Casq1O09165 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Casq1O09165 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Casq1O09165 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Casq1O09165 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Casq1O09165 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Casq1O09165 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Casq1O09165 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Casq1O09165 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Casq1O09165 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Casq1O09165 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Casq1O09165 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Casq1O09165 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Casq1O09165 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Casq1O09165 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Casq1O09165 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Casq1O09165 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Casq1O09165 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Casq1O09165 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Casq1O09165 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Casq1O09165 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Casq1O09165 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Casq1O09165 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Casq1O09165 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Casq1O09165 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Casq1O09165 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Casq1O09165 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Casq1O09165 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Casq1O09165 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Casq1O09165 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Casq1O09165 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Casq1O09165 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Casq1O09165 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Casq1O09165 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Casq1O09165 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Casq1O09165 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Casq1O09165 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Casq1O09165 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Casq1O09165 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Casq1O09165 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Casq1O09165 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Casq1O09165 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Casq1O09165 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Casq1O09165 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Casq1O09165 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Casq1O09165 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Casq1O09165 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Casq1O09165 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Casq1O09165 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Casq1O09165 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Casq1O09165 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Casq1O09165 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Casq1O09165 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Casq1O09165 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Casq1O09165 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Casq1O09165 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms