Protein–RNA interactions for Protein: O08842

Gfra2, GDNF family receptor alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra2O08842 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gfra2O08842 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gfra2O08842 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gfra2O08842 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gfra2O08842 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gfra2O08842 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gfra2O08842 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gfra2O08842 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gfra2O08842 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gfra2O08842 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gfra2O08842 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gfra2O08842 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gfra2O08842 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gfra2O08842 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gfra2O08842 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gfra2O08842 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gfra2O08842 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gfra2O08842 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gfra2O08842 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gfra2O08842 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gfra2O08842 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gfra2O08842 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gfra2O08842 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gfra2O08842 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gfra2O08842 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gfra2O08842 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gfra2O08842 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gfra2O08842 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gfra2O08842 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gfra2O08842 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gfra2O08842 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gfra2O08842 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gfra2O08842 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gfra2O08842 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gfra2O08842 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gfra2O08842 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gfra2O08842 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gfra2O08842 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gfra2O08842 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gfra2O08842 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gfra2O08842 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Gfra2O08842 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gfra2O08842 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gfra2O08842 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gfra2O08842 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gfra2O08842 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gfra2O08842 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gfra2O08842 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gfra2O08842 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gfra2O08842 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gfra2O08842 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gfra2O08842 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gfra2O08842 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gfra2O08842 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gfra2O08842 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gfra2O08842 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gfra2O08842 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Gfra2O08842 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Gfra2O08842 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gfra2O08842 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gfra2O08842 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gfra2O08842 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gfra2O08842 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gfra2O08842 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gfra2O08842 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gfra2O08842 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gfra2O08842 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gfra2O08842 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gfra2O08842 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gfra2O08842 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gfra2O08842 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gfra2O08842 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gfra2O08842 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gfra2O08842 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gfra2O08842 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gfra2O08842 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gfra2O08842 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gfra2O08842 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gfra2O08842 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gfra2O08842 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gfra2O08842 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gfra2O08842 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gfra2O08842 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gfra2O08842 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gfra2O08842 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gfra2O08842 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gfra2O08842 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gfra2O08842 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gfra2O08842 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gfra2O08842 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gfra2O08842 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gfra2O08842 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gfra2O08842 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gfra2O08842 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Gfra2O08842 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Gfra2O08842 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gfra2O08842 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gfra2O08842 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gfra2O08842 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gfra2O08842 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms