Protein–RNA interactions for Protein: O08529

Capn2, Calpain-2 catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn2O08529 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Capn2O08529 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Capn2O08529 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Capn2O08529 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Capn2O08529 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Capn2O08529 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Capn2O08529 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Capn2O08529 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Capn2O08529 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Capn2O08529 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Capn2O08529 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Capn2O08529 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Capn2O08529 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Capn2O08529 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Capn2O08529 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Capn2O08529 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Capn2O08529 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Capn2O08529 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Capn2O08529 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Capn2O08529 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Capn2O08529 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Capn2O08529 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Capn2O08529 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Capn2O08529 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Capn2O08529 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Capn2O08529 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Capn2O08529 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Capn2O08529 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Capn2O08529 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Capn2O08529 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Capn2O08529 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Capn2O08529 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Capn2O08529 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Capn2O08529 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Capn2O08529 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Capn2O08529 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Capn2O08529 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Capn2O08529 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Capn2O08529 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Capn2O08529 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Capn2O08529 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Capn2O08529 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Capn2O08529 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Capn2O08529 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Capn2O08529 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Capn2O08529 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Capn2O08529 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Capn2O08529 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Capn2O08529 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Capn2O08529 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Capn2O08529 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Capn2O08529 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Capn2O08529 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Capn2O08529 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Capn2O08529 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Capn2O08529 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Capn2O08529 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Capn2O08529 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Capn2O08529 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Capn2O08529 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Capn2O08529 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Capn2O08529 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Capn2O08529 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Capn2O08529 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Capn2O08529 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Capn2O08529 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Capn2O08529 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Capn2O08529 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Capn2O08529 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Capn2O08529 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Capn2O08529 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Capn2O08529 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Capn2O08529 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Capn2O08529 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Capn2O08529 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Capn2O08529 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Capn2O08529 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Capn2O08529 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Capn2O08529 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Capn2O08529 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Capn2O08529 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Capn2O08529 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Capn2O08529 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Capn2O08529 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Capn2O08529 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Capn2O08529 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Capn2O08529 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Capn2O08529 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Capn2O08529 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Capn2O08529 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Capn2O08529 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Capn2O08529 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Capn2O08529 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Capn2O08529 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Capn2O08529 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Capn2O08529 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Capn2O08529 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Capn2O08529 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Capn2O08529 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Capn2O08529 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms