Protein–RNA interactions for Protein: L7N243

Gm20939, Predicted gene, 20939, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20939L7N243 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm20939L7N243 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm20939L7N243 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm20939L7N243 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm20939L7N243 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm20939L7N243 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm20939L7N243 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm20939L7N243 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm20939L7N243 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm20939L7N243 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm20939L7N243 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm20939L7N243 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm20939L7N243 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm20939L7N243 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm20939L7N243 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm20939L7N243 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm20939L7N243 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm20939L7N243 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm20939L7N243 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm20939L7N243 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm20939L7N243 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm20939L7N243 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm20939L7N243 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm20939L7N243 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm20939L7N243 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm20939L7N243 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm20939L7N243 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm20939L7N243 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm20939L7N243 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm20939L7N243 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm20939L7N243 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm20939L7N243 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm20939L7N243 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm20939L7N243 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm20939L7N243 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm20939L7N243 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm20939L7N243 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm20939L7N243 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm20939L7N243 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm20939L7N243 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm20939L7N243 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm20939L7N243 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm20939L7N243 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm20939L7N243 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm20939L7N243 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm20939L7N243 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm20939L7N243 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm20939L7N243 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm20939L7N243 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm20939L7N243 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm20939L7N243 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm20939L7N243 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm20939L7N243 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm20939L7N243 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm20939L7N243 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm20939L7N243 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm20939L7N243 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm20939L7N243 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm20939L7N243 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm20939L7N243 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm20939L7N243 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm20939L7N243 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm20939L7N243 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm20939L7N243 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm20939L7N243 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm20939L7N243 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm20939L7N243 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm20939L7N243 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm20939L7N243 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm20939L7N243 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm20939L7N243 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm20939L7N243 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm20939L7N243 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm20939L7N243 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm20939L7N243 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm20939L7N243 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm20939L7N243 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm20939L7N243 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm20939L7N243 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm20939L7N243 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm20939L7N243 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm20939L7N243 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm20939L7N243 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm20939L7N243 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm20939L7N243 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm20939L7N243 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm20939L7N243 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm20939L7N243 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm20939L7N243 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm20939L7N243 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm20939L7N243 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm20939L7N243 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm20939L7N243 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm20939L7N243 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm20939L7N243 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm20939L7N243 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm20939L7N243 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm20939L7N243 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm20939L7N243 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm20939L7N243 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
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