Protein–RNA interactions for Protein: L7N1X0

Gm28044, Predicted gene, 28044, mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28044L7N1X0 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm28044L7N1X0 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm28044L7N1X0 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm28044L7N1X0 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm28044L7N1X0 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm28044L7N1X0 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm28044L7N1X0 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm28044L7N1X0 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm28044L7N1X0 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm28044L7N1X0 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm28044L7N1X0 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm28044L7N1X0 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm28044L7N1X0 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm28044L7N1X0 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm28044L7N1X0 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm28044L7N1X0 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm28044L7N1X0 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm28044L7N1X0 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm28044L7N1X0 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm28044L7N1X0 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm28044L7N1X0 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm28044L7N1X0 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm28044L7N1X0 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm28044L7N1X0 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm28044L7N1X0 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm28044L7N1X0 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm28044L7N1X0 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm28044L7N1X0 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm28044L7N1X0 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm28044L7N1X0 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm28044L7N1X0 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm28044L7N1X0 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm28044L7N1X0 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm28044L7N1X0 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm28044L7N1X0 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm28044L7N1X0 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm28044L7N1X0 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm28044L7N1X0 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm28044L7N1X0 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm28044L7N1X0 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm28044L7N1X0 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm28044L7N1X0 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm28044L7N1X0 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm28044L7N1X0 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm28044L7N1X0 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm28044L7N1X0 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm28044L7N1X0 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm28044L7N1X0 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm28044L7N1X0 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm28044L7N1X0 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm28044L7N1X0 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm28044L7N1X0 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm28044L7N1X0 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm28044L7N1X0 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm28044L7N1X0 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm28044L7N1X0 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm28044L7N1X0 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm28044L7N1X0 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm28044L7N1X0 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm28044L7N1X0 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm28044L7N1X0 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm28044L7N1X0 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm28044L7N1X0 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm28044L7N1X0 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm28044L7N1X0 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm28044L7N1X0 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm28044L7N1X0 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm28044L7N1X0 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm28044L7N1X0 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm28044L7N1X0 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm28044L7N1X0 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm28044L7N1X0 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm28044L7N1X0 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm28044L7N1X0 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm28044L7N1X0 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm28044L7N1X0 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm28044L7N1X0 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm28044L7N1X0 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm28044L7N1X0 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm28044L7N1X0 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm28044L7N1X0 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm28044L7N1X0 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm28044L7N1X0 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm28044L7N1X0 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm28044L7N1X0 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm28044L7N1X0 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm28044L7N1X0 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm28044L7N1X0 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm28044L7N1X0 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm28044L7N1X0 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm28044L7N1X0 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm28044L7N1X0 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm28044L7N1X0 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm28044L7N1X0 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm28044L7N1X0 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm28044L7N1X0 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm28044L7N1X0 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm28044L7N1X0 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm28044L7N1X0 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm28044L7N1X0 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
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