Protein–RNA interactions for Protein: L7MU04

H2al1o, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1oL7MU04 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
H2al1oL7MU04 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
H2al1oL7MU04 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
H2al1oL7MU04 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2al1oL7MU04 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
H2al1oL7MU04 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2al1oL7MU04 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2al1oL7MU04 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2al1oL7MU04 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2al1oL7MU04 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2al1oL7MU04 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2al1oL7MU04 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2al1oL7MU04 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2al1oL7MU04 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
H2al1oL7MU04 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
H2al1oL7MU04 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
H2al1oL7MU04 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
H2al1oL7MU04 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
H2al1oL7MU04 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
H2al1oL7MU04 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
H2al1oL7MU04 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
H2al1oL7MU04 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
H2al1oL7MU04 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
H2al1oL7MU04 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
H2al1oL7MU04 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
H2al1oL7MU04 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
H2al1oL7MU04 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
H2al1oL7MU04 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
H2al1oL7MU04 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
H2al1oL7MU04 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
H2al1oL7MU04 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2al1oL7MU04 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2al1oL7MU04 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2al1oL7MU04 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2al1oL7MU04 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2al1oL7MU04 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2al1oL7MU04 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2al1oL7MU04 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2al1oL7MU04 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
H2al1oL7MU04 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
H2al1oL7MU04 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
H2al1oL7MU04 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
H2al1oL7MU04 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2al1oL7MU04 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2al1oL7MU04 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2al1oL7MU04 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2al1oL7MU04 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2al1oL7MU04 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2al1oL7MU04 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2al1oL7MU04 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2al1oL7MU04 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
H2al1oL7MU04 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2al1oL7MU04 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2al1oL7MU04 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
H2al1oL7MU04 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2al1oL7MU04 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2al1oL7MU04 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
H2al1oL7MU04 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2al1oL7MU04 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2al1oL7MU04 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2al1oL7MU04 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2al1oL7MU04 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2al1oL7MU04 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
H2al1oL7MU04 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2al1oL7MU04 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2al1oL7MU04 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2al1oL7MU04 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2al1oL7MU04 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2al1oL7MU04 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2al1oL7MU04 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2al1oL7MU04 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
H2al1oL7MU04 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
H2al1oL7MU04 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
H2al1oL7MU04 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
H2al1oL7MU04 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2al1oL7MU04 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2al1oL7MU04 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2al1oL7MU04 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2al1oL7MU04 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2al1oL7MU04 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2al1oL7MU04 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2al1oL7MU04 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2al1oL7MU04 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2al1oL7MU04 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
H2al1oL7MU04 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
H2al1oL7MU04 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
H2al1oL7MU04 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
H2al1oL7MU04 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2al1oL7MU04 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2al1oL7MU04 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2al1oL7MU04 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2al1oL7MU04 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2al1oL7MU04 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2al1oL7MU04 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2al1oL7MU04 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2al1oL7MU04 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2al1oL7MU04 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2al1oL7MU04 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2al1oL7MU04 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2al1oL7MU04 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms