Protein–RNA interactions for Protein: J3QPU5

Ccer2, Coiled-coil glutamate-rich protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer2J3QPU5 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Ccer2J3QPU5 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Ccer2J3QPU5 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Ccer2J3QPU5 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Ccer2J3QPU5 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
Ccer2J3QPU5 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Ccer2J3QPU5 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Ccer2J3QPU5 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Ccer2J3QPU5 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Ccer2J3QPU5 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Ccer2J3QPU5 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
Ccer2J3QPU5 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC30.76■■■□□ 2.52
Ccer2J3QPU5 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.52
Ccer2J3QPU5 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
Ccer2J3QPU5 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
Ccer2J3QPU5 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Ccer2J3QPU5 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Ccer2J3QPU5 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC30.75■■■□□ 2.51
Ccer2J3QPU5 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
Ccer2J3QPU5 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
Ccer2J3QPU5 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
Ccer2J3QPU5 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Ccer2J3QPU5 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC30.74■■■□□ 2.51
Ccer2J3QPU5 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Ccer2J3QPU5 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Ccer2J3QPU5 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Ccer2J3QPU5 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Ccer2J3QPU5 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Ccer2J3QPU5 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC30.72■■■□□ 2.51
Ccer2J3QPU5 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Ccer2J3QPU5 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
Ccer2J3QPU5 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
Ccer2J3QPU5 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
Ccer2J3QPU5 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Ccer2J3QPU5 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC30.71■■■□□ 2.51
Ccer2J3QPU5 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Ccer2J3QPU5 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Ccer2J3QPU5 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Ccer2J3QPU5 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC30.7■■■□□ 2.51
Ccer2J3QPU5 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Ccer2J3QPU5 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Ccer2J3QPU5 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC30.7■■■□□ 2.51
Ccer2J3QPU5 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
Ccer2J3QPU5 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Ccer2J3QPU5 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Ccer2J3QPU5 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Ccer2J3QPU5 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Ccer2J3QPU5 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Ccer2J3QPU5 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Ccer2J3QPU5 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Ccer2J3QPU5 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC30.68■■■□□ 2.5
Ccer2J3QPU5 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
Ccer2J3QPU5 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Ccer2J3QPU5 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Ccer2J3QPU5 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC30.67■■■□□ 2.5
Ccer2J3QPU5 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
Ccer2J3QPU5 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Ccer2J3QPU5 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC30.67■■■□□ 2.5
Ccer2J3QPU5 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Ccer2J3QPU5 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Ccer2J3QPU5 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Ccer2J3QPU5 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Ccer2J3QPU5 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
Ccer2J3QPU5 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Ccer2J3QPU5 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Ccer2J3QPU5 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Ccer2J3QPU5 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Ccer2J3QPU5 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Ccer2J3QPU5 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
Ccer2J3QPU5 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Ccer2J3QPU5 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Ccer2J3QPU5 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
Ccer2J3QPU5 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Ccer2J3QPU5 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
Ccer2J3QPU5 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Ccer2J3QPU5 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Ccer2J3QPU5 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Ccer2J3QPU5 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Ccer2J3QPU5 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Ccer2J3QPU5 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Ccer2J3QPU5 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Ccer2J3QPU5 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Ccer2J3QPU5 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Ccer2J3QPU5 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Ccer2J3QPU5 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Ccer2J3QPU5 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Ccer2J3QPU5 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Ccer2J3QPU5 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Ccer2J3QPU5 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Ccer2J3QPU5 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Ccer2J3QPU5 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
Ccer2J3QPU5 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Ccer2J3QPU5 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
Ccer2J3QPU5 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
Ccer2J3QPU5 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Ccer2J3QPU5 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Ccer2J3QPU5 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Ccer2J3QPU5 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
Ccer2J3QPU5 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Ccer2J3QPU5 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms