Protein–RNA interactions for Protein: J3QNY8

Gm19965, Predicted gene, 19965, mousemouse

Predictions only

Length 723 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm19965J3QNY8 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gm19965J3QNY8 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gm19965J3QNY8 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gm19965J3QNY8 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gm19965J3QNY8 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Gm19965J3QNY8 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gm19965J3QNY8 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gm19965J3QNY8 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gm19965J3QNY8 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gm19965J3QNY8 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gm19965J3QNY8 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gm19965J3QNY8 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gm19965J3QNY8 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gm19965J3QNY8 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gm19965J3QNY8 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gm19965J3QNY8 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Gm19965J3QNY8 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gm19965J3QNY8 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gm19965J3QNY8 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gm19965J3QNY8 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Gm19965J3QNY8 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Gm19965J3QNY8 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Gm19965J3QNY8 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gm19965J3QNY8 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gm19965J3QNY8 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gm19965J3QNY8 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gm19965J3QNY8 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gm19965J3QNY8 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gm19965J3QNY8 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gm19965J3QNY8 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gm19965J3QNY8 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gm19965J3QNY8 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gm19965J3QNY8 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gm19965J3QNY8 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gm19965J3QNY8 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gm19965J3QNY8 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gm19965J3QNY8 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gm19965J3QNY8 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gm19965J3QNY8 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gm19965J3QNY8 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Gm19965J3QNY8 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gm19965J3QNY8 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gm19965J3QNY8 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gm19965J3QNY8 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gm19965J3QNY8 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gm19965J3QNY8 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gm19965J3QNY8 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gm19965J3QNY8 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gm19965J3QNY8 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gm19965J3QNY8 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gm19965J3QNY8 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gm19965J3QNY8 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gm19965J3QNY8 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gm19965J3QNY8 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gm19965J3QNY8 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gm19965J3QNY8 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gm19965J3QNY8 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gm19965J3QNY8 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gm19965J3QNY8 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gm19965J3QNY8 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gm19965J3QNY8 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Gm19965J3QNY8 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm19965J3QNY8 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm19965J3QNY8 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm19965J3QNY8 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm19965J3QNY8 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm19965J3QNY8 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm19965J3QNY8 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm19965J3QNY8 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm19965J3QNY8 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm19965J3QNY8 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gm19965J3QNY8 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gm19965J3QNY8 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gm19965J3QNY8 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gm19965J3QNY8 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gm19965J3QNY8 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gm19965J3QNY8 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gm19965J3QNY8 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gm19965J3QNY8 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gm19965J3QNY8 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gm19965J3QNY8 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm19965J3QNY8 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm19965J3QNY8 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm19965J3QNY8 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm19965J3QNY8 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm19965J3QNY8 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm19965J3QNY8 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm19965J3QNY8 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm19965J3QNY8 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm19965J3QNY8 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm19965J3QNY8 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm19965J3QNY8 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm19965J3QNY8 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm19965J3QNY8 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm19965J3QNY8 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm19965J3QNY8 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm19965J3QNY8 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm19965J3QNY8 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm19965J3QNY8 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm19965J3QNY8 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms