Protein–RNA interactions for Protein: J3QNY1

Gm9242, Predicted pseudogene 9242, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9242J3QNY1 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm9242J3QNY1 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm9242J3QNY1 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm9242J3QNY1 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm9242J3QNY1 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm9242J3QNY1 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm9242J3QNY1 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm9242J3QNY1 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm9242J3QNY1 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm9242J3QNY1 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm9242J3QNY1 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm9242J3QNY1 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm9242J3QNY1 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm9242J3QNY1 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm9242J3QNY1 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm9242J3QNY1 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm9242J3QNY1 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm9242J3QNY1 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm9242J3QNY1 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm9242J3QNY1 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm9242J3QNY1 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm9242J3QNY1 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm9242J3QNY1 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm9242J3QNY1 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm9242J3QNY1 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm9242J3QNY1 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm9242J3QNY1 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm9242J3QNY1 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm9242J3QNY1 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm9242J3QNY1 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm9242J3QNY1 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm9242J3QNY1 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm9242J3QNY1 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm9242J3QNY1 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm9242J3QNY1 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm9242J3QNY1 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm9242J3QNY1 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm9242J3QNY1 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm9242J3QNY1 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm9242J3QNY1 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm9242J3QNY1 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm9242J3QNY1 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm9242J3QNY1 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm9242J3QNY1 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm9242J3QNY1 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm9242J3QNY1 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm9242J3QNY1 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm9242J3QNY1 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm9242J3QNY1 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm9242J3QNY1 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm9242J3QNY1 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm9242J3QNY1 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm9242J3QNY1 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm9242J3QNY1 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm9242J3QNY1 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm9242J3QNY1 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm9242J3QNY1 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm9242J3QNY1 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm9242J3QNY1 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm9242J3QNY1 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm9242J3QNY1 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm9242J3QNY1 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm9242J3QNY1 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm9242J3QNY1 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm9242J3QNY1 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm9242J3QNY1 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm9242J3QNY1 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm9242J3QNY1 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm9242J3QNY1 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm9242J3QNY1 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm9242J3QNY1 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm9242J3QNY1 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm9242J3QNY1 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm9242J3QNY1 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm9242J3QNY1 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm9242J3QNY1 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm9242J3QNY1 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm9242J3QNY1 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm9242J3QNY1 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm9242J3QNY1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm9242J3QNY1 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm9242J3QNY1 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm9242J3QNY1 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm9242J3QNY1 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm9242J3QNY1 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm9242J3QNY1 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm9242J3QNY1 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm9242J3QNY1 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm9242J3QNY1 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm9242J3QNY1 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm9242J3QNY1 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm9242J3QNY1 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm9242J3QNY1 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm9242J3QNY1 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm9242J3QNY1 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm9242J3QNY1 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm9242J3QNY1 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm9242J3QNY1 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm9242J3QNY1 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm9242J3QNY1 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms