Protein–RNA interactions for Protein: J3QN17

Gm20918, Predicted gene, 20918, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20918J3QN17 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm20918J3QN17 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Gm20918J3QN17 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm20918J3QN17 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm20918J3QN17 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm20918J3QN17 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm20918J3QN17 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm20918J3QN17 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm20918J3QN17 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm20918J3QN17 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm20918J3QN17 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm20918J3QN17 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm20918J3QN17 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm20918J3QN17 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm20918J3QN17 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm20918J3QN17 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm20918J3QN17 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm20918J3QN17 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm20918J3QN17 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm20918J3QN17 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm20918J3QN17 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm20918J3QN17 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm20918J3QN17 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm20918J3QN17 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm20918J3QN17 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm20918J3QN17 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm20918J3QN17 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm20918J3QN17 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm20918J3QN17 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm20918J3QN17 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm20918J3QN17 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm20918J3QN17 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm20918J3QN17 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm20918J3QN17 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm20918J3QN17 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm20918J3QN17 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm20918J3QN17 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm20918J3QN17 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm20918J3QN17 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm20918J3QN17 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm20918J3QN17 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm20918J3QN17 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm20918J3QN17 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm20918J3QN17 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm20918J3QN17 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm20918J3QN17 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm20918J3QN17 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm20918J3QN17 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm20918J3QN17 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm20918J3QN17 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm20918J3QN17 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm20918J3QN17 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm20918J3QN17 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm20918J3QN17 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm20918J3QN17 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm20918J3QN17 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm20918J3QN17 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm20918J3QN17 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm20918J3QN17 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm20918J3QN17 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm20918J3QN17 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm20918J3QN17 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm20918J3QN17 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm20918J3QN17 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm20918J3QN17 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Gm20918J3QN17 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm20918J3QN17 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm20918J3QN17 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm20918J3QN17 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm20918J3QN17 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm20918J3QN17 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm20918J3QN17 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm20918J3QN17 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm20918J3QN17 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm20918J3QN17 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm20918J3QN17 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm20918J3QN17 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm20918J3QN17 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm20918J3QN17 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm20918J3QN17 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm20918J3QN17 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm20918J3QN17 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm20918J3QN17 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm20918J3QN17 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm20918J3QN17 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm20918J3QN17 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm20918J3QN17 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm20918J3QN17 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm20918J3QN17 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm20918J3QN17 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm20918J3QN17 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm20918J3QN17 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm20918J3QN17 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm20918J3QN17 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm20918J3QN17 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm20918J3QN17 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm20918J3QN17 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm20918J3QN17 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm20918J3QN17 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm20918J3QN17 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms