Protein–RNA interactions for Protein: J3QMA4

Zfp870, Zinc finger protein 870, mousemouse

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Length 560 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp870J3QMA4 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
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Zfp870J3QMA4 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Zfp870J3QMA4 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
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Zfp870J3QMA4 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
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Zfp870J3QMA4 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Zfp870J3QMA4 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Zfp870J3QMA4 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Zfp870J3QMA4 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Zfp870J3QMA4 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Zfp870J3QMA4 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Zfp870J3QMA4 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Zfp870J3QMA4 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
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Zfp870J3QMA4 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
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Zfp870J3QMA4 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
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Zfp870J3QMA4 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
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Zfp870J3QMA4 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Zfp870J3QMA4 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
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Zfp870J3QMA4 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Zfp870J3QMA4 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
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Zfp870J3QMA4 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Zfp870J3QMA4 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
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Zfp870J3QMA4 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Zfp870J3QMA4 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
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Zfp870J3QMA4 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Zfp870J3QMA4 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
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Zfp870J3QMA4 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
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Zfp870J3QMA4 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
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Zfp870J3QMA4 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Zfp870J3QMA4 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
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Zfp870J3QMA4 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
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Zfp870J3QMA4 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Zfp870J3QMA4 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Zfp870J3QMA4 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
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Zfp870J3QMA4 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Zfp870J3QMA4 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
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Zfp870J3QMA4 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Zfp870J3QMA4 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Zfp870J3QMA4 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Zfp870J3QMA4 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Zfp870J3QMA4 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Zfp870J3QMA4 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Zfp870J3QMA4 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Zfp870J3QMA4 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Zfp870J3QMA4 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Zfp870J3QMA4 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Zfp870J3QMA4 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Zfp870J3QMA4 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Zfp870J3QMA4 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Zfp870J3QMA4 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Zfp870J3QMA4 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Zfp870J3QMA4 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Zfp870J3QMA4 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Zfp870J3QMA4 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Zfp870J3QMA4 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Zfp870J3QMA4 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Zfp870J3QMA4 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Zfp870J3QMA4 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.1 ms