Protein–RNA interactions for Protein: J3KMU4

Gm21060, Predicted gene, 21060, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21060J3KMU4 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm21060J3KMU4 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm21060J3KMU4 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm21060J3KMU4 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm21060J3KMU4 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm21060J3KMU4 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm21060J3KMU4 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm21060J3KMU4 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm21060J3KMU4 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm21060J3KMU4 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm21060J3KMU4 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm21060J3KMU4 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm21060J3KMU4 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm21060J3KMU4 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm21060J3KMU4 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm21060J3KMU4 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm21060J3KMU4 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm21060J3KMU4 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm21060J3KMU4 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm21060J3KMU4 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm21060J3KMU4 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm21060J3KMU4 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm21060J3KMU4 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm21060J3KMU4 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm21060J3KMU4 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Gm21060J3KMU4 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Gm21060J3KMU4 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm21060J3KMU4 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm21060J3KMU4 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm21060J3KMU4 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm21060J3KMU4 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm21060J3KMU4 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm21060J3KMU4 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm21060J3KMU4 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm21060J3KMU4 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm21060J3KMU4 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm21060J3KMU4 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm21060J3KMU4 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm21060J3KMU4 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm21060J3KMU4 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm21060J3KMU4 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm21060J3KMU4 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm21060J3KMU4 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm21060J3KMU4 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm21060J3KMU4 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm21060J3KMU4 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm21060J3KMU4 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm21060J3KMU4 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm21060J3KMU4 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm21060J3KMU4 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm21060J3KMU4 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm21060J3KMU4 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm21060J3KMU4 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm21060J3KMU4 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm21060J3KMU4 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm21060J3KMU4 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm21060J3KMU4 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm21060J3KMU4 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm21060J3KMU4 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm21060J3KMU4 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm21060J3KMU4 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm21060J3KMU4 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm21060J3KMU4 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm21060J3KMU4 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm21060J3KMU4 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm21060J3KMU4 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm21060J3KMU4 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm21060J3KMU4 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm21060J3KMU4 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm21060J3KMU4 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm21060J3KMU4 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm21060J3KMU4 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm21060J3KMU4 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm21060J3KMU4 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm21060J3KMU4 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm21060J3KMU4 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm21060J3KMU4 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm21060J3KMU4 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm21060J3KMU4 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm21060J3KMU4 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm21060J3KMU4 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm21060J3KMU4 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm21060J3KMU4 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm21060J3KMU4 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm21060J3KMU4 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm21060J3KMU4 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm21060J3KMU4 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm21060J3KMU4 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm21060J3KMU4 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm21060J3KMU4 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm21060J3KMU4 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm21060J3KMU4 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm21060J3KMU4 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm21060J3KMU4 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm21060J3KMU4 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm21060J3KMU4 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm21060J3KMU4 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm21060J3KMU4 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm21060J3KMU4 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm21060J3KMU4 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms