Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS6

Gm21818, MCG122238, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21818J3KMS6 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm21818J3KMS6 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm21818J3KMS6 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm21818J3KMS6 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm21818J3KMS6 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm21818J3KMS6 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm21818J3KMS6 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm21818J3KMS6 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm21818J3KMS6 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm21818J3KMS6 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm21818J3KMS6 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm21818J3KMS6 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm21818J3KMS6 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm21818J3KMS6 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm21818J3KMS6 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm21818J3KMS6 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm21818J3KMS6 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm21818J3KMS6 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm21818J3KMS6 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm21818J3KMS6 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm21818J3KMS6 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm21818J3KMS6 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm21818J3KMS6 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm21818J3KMS6 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm21818J3KMS6 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm21818J3KMS6 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm21818J3KMS6 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm21818J3KMS6 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm21818J3KMS6 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm21818J3KMS6 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm21818J3KMS6 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm21818J3KMS6 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm21818J3KMS6 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm21818J3KMS6 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm21818J3KMS6 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm21818J3KMS6 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm21818J3KMS6 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm21818J3KMS6 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm21818J3KMS6 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm21818J3KMS6 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm21818J3KMS6 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm21818J3KMS6 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm21818J3KMS6 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm21818J3KMS6 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm21818J3KMS6 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm21818J3KMS6 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm21818J3KMS6 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm21818J3KMS6 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm21818J3KMS6 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm21818J3KMS6 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm21818J3KMS6 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm21818J3KMS6 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm21818J3KMS6 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm21818J3KMS6 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm21818J3KMS6 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm21818J3KMS6 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm21818J3KMS6 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm21818J3KMS6 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm21818J3KMS6 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm21818J3KMS6 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm21818J3KMS6 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm21818J3KMS6 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm21818J3KMS6 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm21818J3KMS6 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm21818J3KMS6 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm21818J3KMS6 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm21818J3KMS6 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm21818J3KMS6 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm21818J3KMS6 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm21818J3KMS6 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm21818J3KMS6 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm21818J3KMS6 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm21818J3KMS6 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm21818J3KMS6 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm21818J3KMS6 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm21818J3KMS6 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm21818J3KMS6 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm21818J3KMS6 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm21818J3KMS6 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm21818J3KMS6 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm21818J3KMS6 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm21818J3KMS6 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm21818J3KMS6 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm21818J3KMS6 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm21818J3KMS6 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm21818J3KMS6 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm21818J3KMS6 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm21818J3KMS6 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm21818J3KMS6 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm21818J3KMS6 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm21818J3KMS6 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm21818J3KMS6 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm21818J3KMS6 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm21818J3KMS6 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm21818J3KMS6 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm21818J3KMS6 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm21818J3KMS6 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm21818J3KMS6 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm21818J3KMS6 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm21818J3KMS6 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms