Protein–RNA interactions for Protein: J3KML6

Gm20830, Predicted gene, 20830, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20830J3KML6 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm20830J3KML6 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm20830J3KML6 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm20830J3KML6 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm20830J3KML6 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm20830J3KML6 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm20830J3KML6 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm20830J3KML6 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm20830J3KML6 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm20830J3KML6 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm20830J3KML6 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm20830J3KML6 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm20830J3KML6 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm20830J3KML6 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm20830J3KML6 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm20830J3KML6 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm20830J3KML6 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm20830J3KML6 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm20830J3KML6 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm20830J3KML6 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm20830J3KML6 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm20830J3KML6 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm20830J3KML6 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm20830J3KML6 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm20830J3KML6 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm20830J3KML6 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm20830J3KML6 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm20830J3KML6 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm20830J3KML6 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm20830J3KML6 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm20830J3KML6 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm20830J3KML6 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm20830J3KML6 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm20830J3KML6 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm20830J3KML6 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm20830J3KML6 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm20830J3KML6 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm20830J3KML6 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm20830J3KML6 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm20830J3KML6 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm20830J3KML6 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm20830J3KML6 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm20830J3KML6 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm20830J3KML6 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm20830J3KML6 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm20830J3KML6 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm20830J3KML6 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm20830J3KML6 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm20830J3KML6 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm20830J3KML6 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm20830J3KML6 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm20830J3KML6 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm20830J3KML6 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm20830J3KML6 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm20830J3KML6 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm20830J3KML6 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm20830J3KML6 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm20830J3KML6 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm20830J3KML6 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm20830J3KML6 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm20830J3KML6 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm20830J3KML6 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm20830J3KML6 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm20830J3KML6 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm20830J3KML6 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm20830J3KML6 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm20830J3KML6 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm20830J3KML6 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm20830J3KML6 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm20830J3KML6 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm20830J3KML6 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm20830J3KML6 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm20830J3KML6 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm20830J3KML6 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm20830J3KML6 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm20830J3KML6 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm20830J3KML6 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm20830J3KML6 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm20830J3KML6 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm20830J3KML6 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm20830J3KML6 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm20830J3KML6 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm20830J3KML6 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm20830J3KML6 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm20830J3KML6 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm20830J3KML6 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm20830J3KML6 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm20830J3KML6 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm20830J3KML6 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm20830J3KML6 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm20830J3KML6 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm20830J3KML6 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm20830J3KML6 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm20830J3KML6 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm20830J3KML6 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm20830J3KML6 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm20830J3KML6 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm20830J3KML6 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm20830J3KML6 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm20830J3KML6 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms