Protein–RNA interactions for Protein: H7BX78

Zfp408, Zinc finger protein 408, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp408H7BX78 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zfp408H7BX78 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zfp408H7BX78 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Zfp408H7BX78 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Zfp408H7BX78 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Zfp408H7BX78 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Zfp408H7BX78 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Zfp408H7BX78 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Zfp408H7BX78 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Zfp408H7BX78 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Zfp408H7BX78 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Zfp408H7BX78 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Zfp408H7BX78 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Zfp408H7BX78 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zfp408H7BX78 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zfp408H7BX78 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zfp408H7BX78 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zfp408H7BX78 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Zfp408H7BX78 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Zfp408H7BX78 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zfp408H7BX78 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zfp408H7BX78 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zfp408H7BX78 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zfp408H7BX78 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zfp408H7BX78 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zfp408H7BX78 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zfp408H7BX78 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zfp408H7BX78 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zfp408H7BX78 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zfp408H7BX78 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zfp408H7BX78 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zfp408H7BX78 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zfp408H7BX78 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zfp408H7BX78 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zfp408H7BX78 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zfp408H7BX78 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zfp408H7BX78 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zfp408H7BX78 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zfp408H7BX78 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zfp408H7BX78 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zfp408H7BX78 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zfp408H7BX78 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zfp408H7BX78 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zfp408H7BX78 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zfp408H7BX78 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zfp408H7BX78 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zfp408H7BX78 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zfp408H7BX78 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zfp408H7BX78 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zfp408H7BX78 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Zfp408H7BX78 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Zfp408H7BX78 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Zfp408H7BX78 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Zfp408H7BX78 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Zfp408H7BX78 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Zfp408H7BX78 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Zfp408H7BX78 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Zfp408H7BX78 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Zfp408H7BX78 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Zfp408H7BX78 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Zfp408H7BX78 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Zfp408H7BX78 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Zfp408H7BX78 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zfp408H7BX78 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zfp408H7BX78 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zfp408H7BX78 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zfp408H7BX78 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zfp408H7BX78 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zfp408H7BX78 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zfp408H7BX78 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zfp408H7BX78 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zfp408H7BX78 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zfp408H7BX78 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zfp408H7BX78 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zfp408H7BX78 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zfp408H7BX78 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zfp408H7BX78 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zfp408H7BX78 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zfp408H7BX78 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zfp408H7BX78 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zfp408H7BX78 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zfp408H7BX78 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zfp408H7BX78 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zfp408H7BX78 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zfp408H7BX78 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zfp408H7BX78 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zfp408H7BX78 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Zfp408H7BX78 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Zfp408H7BX78 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Zfp408H7BX78 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Zfp408H7BX78 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Zfp408H7BX78 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Zfp408H7BX78 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Zfp408H7BX78 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Zfp408H7BX78 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Zfp408H7BX78 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Zfp408H7BX78 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Zfp408H7BX78 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Zfp408H7BX78 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Zfp408H7BX78 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms