Protein–RNA interactions for Protein: H3BIW7

Gm29394, Predicted gene 29394, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29394H3BIW7 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm29394H3BIW7 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm29394H3BIW7 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm29394H3BIW7 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm29394H3BIW7 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm29394H3BIW7 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm29394H3BIW7 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm29394H3BIW7 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm29394H3BIW7 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm29394H3BIW7 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm29394H3BIW7 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm29394H3BIW7 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Gm29394H3BIW7 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm29394H3BIW7 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm29394H3BIW7 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm29394H3BIW7 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm29394H3BIW7 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm29394H3BIW7 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm29394H3BIW7 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm29394H3BIW7 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm29394H3BIW7 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm29394H3BIW7 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm29394H3BIW7 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm29394H3BIW7 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm29394H3BIW7 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm29394H3BIW7 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm29394H3BIW7 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm29394H3BIW7 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm29394H3BIW7 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm29394H3BIW7 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm29394H3BIW7 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm29394H3BIW7 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm29394H3BIW7 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm29394H3BIW7 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm29394H3BIW7 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm29394H3BIW7 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm29394H3BIW7 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm29394H3BIW7 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm29394H3BIW7 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm29394H3BIW7 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm29394H3BIW7 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm29394H3BIW7 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm29394H3BIW7 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm29394H3BIW7 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm29394H3BIW7 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm29394H3BIW7 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm29394H3BIW7 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm29394H3BIW7 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm29394H3BIW7 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm29394H3BIW7 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm29394H3BIW7 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm29394H3BIW7 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm29394H3BIW7 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm29394H3BIW7 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm29394H3BIW7 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm29394H3BIW7 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm29394H3BIW7 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm29394H3BIW7 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm29394H3BIW7 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm29394H3BIW7 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm29394H3BIW7 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm29394H3BIW7 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm29394H3BIW7 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm29394H3BIW7 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm29394H3BIW7 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm29394H3BIW7 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm29394H3BIW7 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm29394H3BIW7 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm29394H3BIW7 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm29394H3BIW7 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm29394H3BIW7 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm29394H3BIW7 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm29394H3BIW7 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm29394H3BIW7 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm29394H3BIW7 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm29394H3BIW7 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm29394H3BIW7 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm29394H3BIW7 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm29394H3BIW7 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm29394H3BIW7 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm29394H3BIW7 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm29394H3BIW7 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm29394H3BIW7 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm29394H3BIW7 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm29394H3BIW7 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm29394H3BIW7 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm29394H3BIW7 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm29394H3BIW7 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm29394H3BIW7 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm29394H3BIW7 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm29394H3BIW7 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm29394H3BIW7 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gm29394H3BIW7 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gm29394H3BIW7 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm29394H3BIW7 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm29394H3BIW7 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm29394H3BIW7 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm29394H3BIW7 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm29394H3BIW7 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm29394H3BIW7 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms