Protein–RNA interactions for Protein: G3XA52

Vmn1r34, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r34G3XA52 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vmn1r34G3XA52 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vmn1r34G3XA52 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vmn1r34G3XA52 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vmn1r34G3XA52 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vmn1r34G3XA52 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vmn1r34G3XA52 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vmn1r34G3XA52 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vmn1r34G3XA52 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vmn1r34G3XA52 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vmn1r34G3XA52 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vmn1r34G3XA52 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Vmn1r34G3XA52 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Vmn1r34G3XA52 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Vmn1r34G3XA52 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Vmn1r34G3XA52 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vmn1r34G3XA52 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vmn1r34G3XA52 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vmn1r34G3XA52 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vmn1r34G3XA52 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Vmn1r34G3XA52 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vmn1r34G3XA52 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vmn1r34G3XA52 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vmn1r34G3XA52 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vmn1r34G3XA52 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vmn1r34G3XA52 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vmn1r34G3XA52 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vmn1r34G3XA52 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vmn1r34G3XA52 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vmn1r34G3XA52 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vmn1r34G3XA52 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vmn1r34G3XA52 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vmn1r34G3XA52 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vmn1r34G3XA52 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vmn1r34G3XA52 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vmn1r34G3XA52 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vmn1r34G3XA52 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vmn1r34G3XA52 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vmn1r34G3XA52 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vmn1r34G3XA52 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Vmn1r34G3XA52 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Vmn1r34G3XA52 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vmn1r34G3XA52 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vmn1r34G3XA52 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vmn1r34G3XA52 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vmn1r34G3XA52 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vmn1r34G3XA52 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vmn1r34G3XA52 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vmn1r34G3XA52 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vmn1r34G3XA52 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vmn1r34G3XA52 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vmn1r34G3XA52 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vmn1r34G3XA52 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vmn1r34G3XA52 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vmn1r34G3XA52 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vmn1r34G3XA52 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vmn1r34G3XA52 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vmn1r34G3XA52 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vmn1r34G3XA52 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Vmn1r34G3XA52 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vmn1r34G3XA52 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vmn1r34G3XA52 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vmn1r34G3XA52 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vmn1r34G3XA52 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vmn1r34G3XA52 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vmn1r34G3XA52 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vmn1r34G3XA52 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vmn1r34G3XA52 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vmn1r34G3XA52 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vmn1r34G3XA52 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vmn1r34G3XA52 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vmn1r34G3XA52 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Vmn1r34G3XA52 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Vmn1r34G3XA52 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vmn1r34G3XA52 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vmn1r34G3XA52 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vmn1r34G3XA52 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Vmn1r34G3XA52 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vmn1r34G3XA52 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vmn1r34G3XA52 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn1r34G3XA52 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn1r34G3XA52 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn1r34G3XA52 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn1r34G3XA52 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn1r34G3XA52 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn1r34G3XA52 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn1r34G3XA52 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn1r34G3XA52 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn1r34G3XA52 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn1r34G3XA52 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn1r34G3XA52 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn1r34G3XA52 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn1r34G3XA52 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn1r34G3XA52 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn1r34G3XA52 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn1r34G3XA52 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmn1r34G3XA52 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmn1r34G3XA52 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmn1r34G3XA52 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmn1r34G3XA52 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms