Protein–RNA interactions for Protein: F6XX07

Gm21970, Predicted gene 21970 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21970F6XX07 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm21970F6XX07 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm21970F6XX07 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm21970F6XX07 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm21970F6XX07 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm21970F6XX07 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm21970F6XX07 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm21970F6XX07 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm21970F6XX07 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm21970F6XX07 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm21970F6XX07 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm21970F6XX07 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm21970F6XX07 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm21970F6XX07 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm21970F6XX07 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm21970F6XX07 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm21970F6XX07 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm21970F6XX07 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm21970F6XX07 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm21970F6XX07 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm21970F6XX07 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm21970F6XX07 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm21970F6XX07 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm21970F6XX07 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm21970F6XX07 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm21970F6XX07 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm21970F6XX07 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm21970F6XX07 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm21970F6XX07 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm21970F6XX07 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm21970F6XX07 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm21970F6XX07 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm21970F6XX07 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gm21970F6XX07 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gm21970F6XX07 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gm21970F6XX07 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gm21970F6XX07 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm21970F6XX07 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm21970F6XX07 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm21970F6XX07 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm21970F6XX07 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm21970F6XX07 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm21970F6XX07 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm21970F6XX07 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm21970F6XX07 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm21970F6XX07 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm21970F6XX07 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm21970F6XX07 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm21970F6XX07 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm21970F6XX07 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm21970F6XX07 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm21970F6XX07 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm21970F6XX07 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm21970F6XX07 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm21970F6XX07 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm21970F6XX07 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm21970F6XX07 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm21970F6XX07 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm21970F6XX07 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm21970F6XX07 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm21970F6XX07 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm21970F6XX07 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm21970F6XX07 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm21970F6XX07 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm21970F6XX07 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm21970F6XX07 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm21970F6XX07 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm21970F6XX07 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm21970F6XX07 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm21970F6XX07 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm21970F6XX07 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm21970F6XX07 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm21970F6XX07 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm21970F6XX07 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm21970F6XX07 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm21970F6XX07 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm21970F6XX07 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm21970F6XX07 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm21970F6XX07 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm21970F6XX07 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm21970F6XX07 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm21970F6XX07 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm21970F6XX07 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm21970F6XX07 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm21970F6XX07 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm21970F6XX07 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm21970F6XX07 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm21970F6XX07 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm21970F6XX07 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm21970F6XX07 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm21970F6XX07 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm21970F6XX07 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm21970F6XX07 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm21970F6XX07 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm21970F6XX07 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm21970F6XX07 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm21970F6XX07 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm21970F6XX07 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm21970F6XX07 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm21970F6XX07 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms