Protein–RNA interactions for Protein: F6UCX4

Sptbn5, Spectrin beta, non-erythrocytic 5 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn5F6UCX4 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sptbn5F6UCX4 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sptbn5F6UCX4 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sptbn5F6UCX4 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sptbn5F6UCX4 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sptbn5F6UCX4 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sptbn5F6UCX4 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sptbn5F6UCX4 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sptbn5F6UCX4 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sptbn5F6UCX4 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sptbn5F6UCX4 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Sptbn5F6UCX4 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sptbn5F6UCX4 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sptbn5F6UCX4 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sptbn5F6UCX4 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sptbn5F6UCX4 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sptbn5F6UCX4 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sptbn5F6UCX4 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sptbn5F6UCX4 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sptbn5F6UCX4 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Sptbn5F6UCX4 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sptbn5F6UCX4 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sptbn5F6UCX4 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sptbn5F6UCX4 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sptbn5F6UCX4 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sptbn5F6UCX4 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sptbn5F6UCX4 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sptbn5F6UCX4 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sptbn5F6UCX4 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sptbn5F6UCX4 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sptbn5F6UCX4 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sptbn5F6UCX4 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sptbn5F6UCX4 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Sptbn5F6UCX4 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sptbn5F6UCX4 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sptbn5F6UCX4 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sptbn5F6UCX4 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sptbn5F6UCX4 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sptbn5F6UCX4 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Sptbn5F6UCX4 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sptbn5F6UCX4 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sptbn5F6UCX4 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sptbn5F6UCX4 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sptbn5F6UCX4 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sptbn5F6UCX4 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sptbn5F6UCX4 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sptbn5F6UCX4 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sptbn5F6UCX4 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sptbn5F6UCX4 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sptbn5F6UCX4 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sptbn5F6UCX4 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sptbn5F6UCX4 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sptbn5F6UCX4 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sptbn5F6UCX4 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sptbn5F6UCX4 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sptbn5F6UCX4 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sptbn5F6UCX4 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Sptbn5F6UCX4 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sptbn5F6UCX4 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sptbn5F6UCX4 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sptbn5F6UCX4 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sptbn5F6UCX4 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sptbn5F6UCX4 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sptbn5F6UCX4 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sptbn5F6UCX4 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sptbn5F6UCX4 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sptbn5F6UCX4 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sptbn5F6UCX4 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sptbn5F6UCX4 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sptbn5F6UCX4 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sptbn5F6UCX4 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sptbn5F6UCX4 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sptbn5F6UCX4 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sptbn5F6UCX4 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sptbn5F6UCX4 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sptbn5F6UCX4 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sptbn5F6UCX4 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Sptbn5F6UCX4 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sptbn5F6UCX4 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sptbn5F6UCX4 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sptbn5F6UCX4 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Sptbn5F6UCX4 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Sptbn5F6UCX4 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Sptbn5F6UCX4 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sptbn5F6UCX4 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sptbn5F6UCX4 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sptbn5F6UCX4 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sptbn5F6UCX4 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sptbn5F6UCX4 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sptbn5F6UCX4 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sptbn5F6UCX4 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sptbn5F6UCX4 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sptbn5F6UCX4 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sptbn5F6UCX4 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sptbn5F6UCX4 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sptbn5F6UCX4 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sptbn5F6UCX4 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sptbn5F6UCX4 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sptbn5F6UCX4 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sptbn5F6UCX4 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms