Protein–RNA interactions for Protein: F6U473

Gm28305, Predicted gene 28305 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28305F6U473 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm28305F6U473 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm28305F6U473 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm28305F6U473 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm28305F6U473 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm28305F6U473 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm28305F6U473 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm28305F6U473 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm28305F6U473 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm28305F6U473 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm28305F6U473 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm28305F6U473 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm28305F6U473 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm28305F6U473 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm28305F6U473 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm28305F6U473 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm28305F6U473 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm28305F6U473 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm28305F6U473 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm28305F6U473 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm28305F6U473 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm28305F6U473 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm28305F6U473 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm28305F6U473 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm28305F6U473 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm28305F6U473 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm28305F6U473 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm28305F6U473 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm28305F6U473 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm28305F6U473 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm28305F6U473 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm28305F6U473 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm28305F6U473 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm28305F6U473 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm28305F6U473 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm28305F6U473 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm28305F6U473 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm28305F6U473 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm28305F6U473 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm28305F6U473 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm28305F6U473 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm28305F6U473 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm28305F6U473 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm28305F6U473 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm28305F6U473 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm28305F6U473 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm28305F6U473 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm28305F6U473 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm28305F6U473 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm28305F6U473 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm28305F6U473 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm28305F6U473 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm28305F6U473 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm28305F6U473 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm28305F6U473 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm28305F6U473 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm28305F6U473 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm28305F6U473 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm28305F6U473 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm28305F6U473 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm28305F6U473 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm28305F6U473 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm28305F6U473 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm28305F6U473 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm28305F6U473 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm28305F6U473 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm28305F6U473 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm28305F6U473 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm28305F6U473 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm28305F6U473 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm28305F6U473 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm28305F6U473 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm28305F6U473 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm28305F6U473 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm28305F6U473 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm28305F6U473 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm28305F6U473 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm28305F6U473 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm28305F6U473 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm28305F6U473 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm28305F6U473 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm28305F6U473 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm28305F6U473 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm28305F6U473 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm28305F6U473 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm28305F6U473 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm28305F6U473 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm28305F6U473 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm28305F6U473 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm28305F6U473 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm28305F6U473 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm28305F6U473 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm28305F6U473 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm28305F6U473 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm28305F6U473 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm28305F6U473 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm28305F6U473 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm28305F6U473 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm28305F6U473 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm28305F6U473 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms