Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9W7

Pdzd7, PDZ domain-containing 7, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd7E9Q9W7 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pdzd7E9Q9W7 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pdzd7E9Q9W7 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pdzd7E9Q9W7 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Pdzd7E9Q9W7 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pdzd7E9Q9W7 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pdzd7E9Q9W7 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pdzd7E9Q9W7 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pdzd7E9Q9W7 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pdzd7E9Q9W7 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pdzd7E9Q9W7 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pdzd7E9Q9W7 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pdzd7E9Q9W7 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pdzd7E9Q9W7 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pdzd7E9Q9W7 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pdzd7E9Q9W7 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pdzd7E9Q9W7 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pdzd7E9Q9W7 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pdzd7E9Q9W7 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Pdzd7E9Q9W7 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pdzd7E9Q9W7 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pdzd7E9Q9W7 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pdzd7E9Q9W7 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pdzd7E9Q9W7 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pdzd7E9Q9W7 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Pdzd7E9Q9W7 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pdzd7E9Q9W7 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pdzd7E9Q9W7 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pdzd7E9Q9W7 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pdzd7E9Q9W7 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pdzd7E9Q9W7 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pdzd7E9Q9W7 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Pdzd7E9Q9W7 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pdzd7E9Q9W7 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pdzd7E9Q9W7 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pdzd7E9Q9W7 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pdzd7E9Q9W7 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pdzd7E9Q9W7 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pdzd7E9Q9W7 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pdzd7E9Q9W7 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pdzd7E9Q9W7 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pdzd7E9Q9W7 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pdzd7E9Q9W7 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pdzd7E9Q9W7 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pdzd7E9Q9W7 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pdzd7E9Q9W7 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pdzd7E9Q9W7 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pdzd7E9Q9W7 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pdzd7E9Q9W7 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pdzd7E9Q9W7 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pdzd7E9Q9W7 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pdzd7E9Q9W7 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pdzd7E9Q9W7 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pdzd7E9Q9W7 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pdzd7E9Q9W7 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Pdzd7E9Q9W7 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Pdzd7E9Q9W7 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pdzd7E9Q9W7 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pdzd7E9Q9W7 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pdzd7E9Q9W7 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pdzd7E9Q9W7 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pdzd7E9Q9W7 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Pdzd7E9Q9W7 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pdzd7E9Q9W7 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pdzd7E9Q9W7 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pdzd7E9Q9W7 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pdzd7E9Q9W7 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pdzd7E9Q9W7 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pdzd7E9Q9W7 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pdzd7E9Q9W7 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pdzd7E9Q9W7 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pdzd7E9Q9W7 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pdzd7E9Q9W7 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pdzd7E9Q9W7 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pdzd7E9Q9W7 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Pdzd7E9Q9W7 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pdzd7E9Q9W7 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pdzd7E9Q9W7 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pdzd7E9Q9W7 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pdzd7E9Q9W7 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pdzd7E9Q9W7 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pdzd7E9Q9W7 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pdzd7E9Q9W7 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pdzd7E9Q9W7 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Pdzd7E9Q9W7 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pdzd7E9Q9W7 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pdzd7E9Q9W7 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Pdzd7E9Q9W7 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pdzd7E9Q9W7 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pdzd7E9Q9W7 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pdzd7E9Q9W7 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pdzd7E9Q9W7 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Pdzd7E9Q9W7 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pdzd7E9Q9W7 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pdzd7E9Q9W7 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pdzd7E9Q9W7 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pdzd7E9Q9W7 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pdzd7E9Q9W7 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pdzd7E9Q9W7 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pdzd7E9Q9W7 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 142 ms