Protein–RNA interactions for Protein: E9Q956

Mcmdc2, Minichromosome maintenance domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 681 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mcmdc2E9Q956 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Mcmdc2E9Q956 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Mcmdc2E9Q956 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Mcmdc2E9Q956 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Mcmdc2E9Q956 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Mcmdc2E9Q956 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Mcmdc2E9Q956 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Mcmdc2E9Q956 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Mcmdc2E9Q956 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Mcmdc2E9Q956 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Mcmdc2E9Q956 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Mcmdc2E9Q956 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Mcmdc2E9Q956 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Mcmdc2E9Q956 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Mcmdc2E9Q956 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Mcmdc2E9Q956 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Mcmdc2E9Q956 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Mcmdc2E9Q956 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Mcmdc2E9Q956 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Mcmdc2E9Q956 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Mcmdc2E9Q956 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Mcmdc2E9Q956 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Mcmdc2E9Q956 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Mcmdc2E9Q956 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Mcmdc2E9Q956 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Mcmdc2E9Q956 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Mcmdc2E9Q956 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Mcmdc2E9Q956 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Mcmdc2E9Q956 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Mcmdc2E9Q956 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Mcmdc2E9Q956 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Mcmdc2E9Q956 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Mcmdc2E9Q956 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Mcmdc2E9Q956 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Mcmdc2E9Q956 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Mcmdc2E9Q956 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Mcmdc2E9Q956 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Mcmdc2E9Q956 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Mcmdc2E9Q956 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Mcmdc2E9Q956 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Mcmdc2E9Q956 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Mcmdc2E9Q956 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Mcmdc2E9Q956 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Mcmdc2E9Q956 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Mcmdc2E9Q956 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Mcmdc2E9Q956 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Mcmdc2E9Q956 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Mcmdc2E9Q956 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Mcmdc2E9Q956 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Mcmdc2E9Q956 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Mcmdc2E9Q956 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Mcmdc2E9Q956 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Mcmdc2E9Q956 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Mcmdc2E9Q956 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Mcmdc2E9Q956 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Mcmdc2E9Q956 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Mcmdc2E9Q956 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Mcmdc2E9Q956 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Mcmdc2E9Q956 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Mcmdc2E9Q956 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Mcmdc2E9Q956 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Mcmdc2E9Q956 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Mcmdc2E9Q956 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Mcmdc2E9Q956 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Mcmdc2E9Q956 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Mcmdc2E9Q956 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Mcmdc2E9Q956 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Mcmdc2E9Q956 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Mcmdc2E9Q956 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Mcmdc2E9Q956 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Mcmdc2E9Q956 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Mcmdc2E9Q956 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Mcmdc2E9Q956 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Mcmdc2E9Q956 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Mcmdc2E9Q956 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Mcmdc2E9Q956 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Mcmdc2E9Q956 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Mcmdc2E9Q956 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Mcmdc2E9Q956 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Mcmdc2E9Q956 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Mcmdc2E9Q956 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Mcmdc2E9Q956 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Mcmdc2E9Q956 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Mcmdc2E9Q956 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Mcmdc2E9Q956 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Mcmdc2E9Q956 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Mcmdc2E9Q956 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Mcmdc2E9Q956 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Mcmdc2E9Q956 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Mcmdc2E9Q956 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Mcmdc2E9Q956 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Mcmdc2E9Q956 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Mcmdc2E9Q956 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Mcmdc2E9Q956 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Mcmdc2E9Q956 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Mcmdc2E9Q956 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Mcmdc2E9Q956 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Mcmdc2E9Q956 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Mcmdc2E9Q956 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Mcmdc2E9Q956 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms