Protein–RNA interactions for Protein: E9Q612

Ptpro, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, mousemouse

Predictions only

Length 1,226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtproE9Q612 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PtproE9Q612 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PtproE9Q612 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
PtproE9Q612 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PtproE9Q612 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PtproE9Q612 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PtproE9Q612 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PtproE9Q612 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PtproE9Q612 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PtproE9Q612 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PtproE9Q612 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PtproE9Q612 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PtproE9Q612 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PtproE9Q612 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PtproE9Q612 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PtproE9Q612 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PtproE9Q612 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PtproE9Q612 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PtproE9Q612 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PtproE9Q612 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PtproE9Q612 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PtproE9Q612 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PtproE9Q612 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PtproE9Q612 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PtproE9Q612 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PtproE9Q612 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PtproE9Q612 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PtproE9Q612 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PtproE9Q612 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PtproE9Q612 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PtproE9Q612 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PtproE9Q612 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PtproE9Q612 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PtproE9Q612 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PtproE9Q612 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PtproE9Q612 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PtproE9Q612 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PtproE9Q612 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
PtproE9Q612 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PtproE9Q612 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PtproE9Q612 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PtproE9Q612 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PtproE9Q612 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PtproE9Q612 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PtproE9Q612 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PtproE9Q612 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PtproE9Q612 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PtproE9Q612 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PtproE9Q612 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PtproE9Q612 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PtproE9Q612 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PtproE9Q612 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PtproE9Q612 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PtproE9Q612 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PtproE9Q612 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PtproE9Q612 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PtproE9Q612 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PtproE9Q612 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PtproE9Q612 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PtproE9Q612 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PtproE9Q612 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PtproE9Q612 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PtproE9Q612 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PtproE9Q612 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PtproE9Q612 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PtproE9Q612 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PtproE9Q612 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PtproE9Q612 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PtproE9Q612 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PtproE9Q612 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PtproE9Q612 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PtproE9Q612 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PtproE9Q612 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PtproE9Q612 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PtproE9Q612 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PtproE9Q612 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PtproE9Q612 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PtproE9Q612 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PtproE9Q612 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PtproE9Q612 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PtproE9Q612 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PtproE9Q612 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PtproE9Q612 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PtproE9Q612 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PtproE9Q612 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PtproE9Q612 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PtproE9Q612 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PtproE9Q612 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PtproE9Q612 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PtproE9Q612 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PtproE9Q612 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PtproE9Q612 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PtproE9Q612 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PtproE9Q612 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PtproE9Q612 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PtproE9Q612 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PtproE9Q612 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PtproE9Q612 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PtproE9Q612 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PtproE9Q612 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms