Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4T4

Ccdc71l, Coiled-coil domain-containing 71-like, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71lE9Q4T4 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc71lE9Q4T4 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc71lE9Q4T4 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc71lE9Q4T4 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc71lE9Q4T4 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc71lE9Q4T4 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc71lE9Q4T4 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc71lE9Q4T4 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc71lE9Q4T4 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc71lE9Q4T4 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc71lE9Q4T4 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc71lE9Q4T4 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc71lE9Q4T4 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc71lE9Q4T4 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc71lE9Q4T4 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc71lE9Q4T4 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc71lE9Q4T4 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc71lE9Q4T4 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc71lE9Q4T4 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc71lE9Q4T4 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc71lE9Q4T4 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc71lE9Q4T4 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc71lE9Q4T4 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc71lE9Q4T4 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc71lE9Q4T4 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc71lE9Q4T4 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc71lE9Q4T4 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc71lE9Q4T4 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc71lE9Q4T4 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc71lE9Q4T4 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc71lE9Q4T4 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc71lE9Q4T4 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc71lE9Q4T4 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc71lE9Q4T4 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc71lE9Q4T4 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc71lE9Q4T4 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc71lE9Q4T4 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc71lE9Q4T4 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc71lE9Q4T4 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc71lE9Q4T4 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc71lE9Q4T4 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc71lE9Q4T4 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc71lE9Q4T4 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc71lE9Q4T4 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc71lE9Q4T4 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc71lE9Q4T4 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc71lE9Q4T4 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc71lE9Q4T4 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc71lE9Q4T4 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc71lE9Q4T4 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc71lE9Q4T4 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc71lE9Q4T4 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc71lE9Q4T4 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc71lE9Q4T4 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc71lE9Q4T4 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccdc71lE9Q4T4 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccdc71lE9Q4T4 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc71lE9Q4T4 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc71lE9Q4T4 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc71lE9Q4T4 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc71lE9Q4T4 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc71lE9Q4T4 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc71lE9Q4T4 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc71lE9Q4T4 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc71lE9Q4T4 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc71lE9Q4T4 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc71lE9Q4T4 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc71lE9Q4T4 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc71lE9Q4T4 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc71lE9Q4T4 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc71lE9Q4T4 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc71lE9Q4T4 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc71lE9Q4T4 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc71lE9Q4T4 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc71lE9Q4T4 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc71lE9Q4T4 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc71lE9Q4T4 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc71lE9Q4T4 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc71lE9Q4T4 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc71lE9Q4T4 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc71lE9Q4T4 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc71lE9Q4T4 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc71lE9Q4T4 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc71lE9Q4T4 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc71lE9Q4T4 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc71lE9Q4T4 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc71lE9Q4T4 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc71lE9Q4T4 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc71lE9Q4T4 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc71lE9Q4T4 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc71lE9Q4T4 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc71lE9Q4T4 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc71lE9Q4T4 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc71lE9Q4T4 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc71lE9Q4T4 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc71lE9Q4T4 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc71lE9Q4T4 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc71lE9Q4T4 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc71lE9Q4T4 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc71lE9Q4T4 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms