Protein–RNA interactions for Protein: E9Q236

Abcc4, ATP-binding cassette, sub-family C (CFTR/MRP), member 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc4E9Q236 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Abcc4E9Q236 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Abcc4E9Q236 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Abcc4E9Q236 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Abcc4E9Q236 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Abcc4E9Q236 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Abcc4E9Q236 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Abcc4E9Q236 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Abcc4E9Q236 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Abcc4E9Q236 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Abcc4E9Q236 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Abcc4E9Q236 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Abcc4E9Q236 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Abcc4E9Q236 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Abcc4E9Q236 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Abcc4E9Q236 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Abcc4E9Q236 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Abcc4E9Q236 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Abcc4E9Q236 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Abcc4E9Q236 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Abcc4E9Q236 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Abcc4E9Q236 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Abcc4E9Q236 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Abcc4E9Q236 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Abcc4E9Q236 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Abcc4E9Q236 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Abcc4E9Q236 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Abcc4E9Q236 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Abcc4E9Q236 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Abcc4E9Q236 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Abcc4E9Q236 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Abcc4E9Q236 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Abcc4E9Q236 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Abcc4E9Q236 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Abcc4E9Q236 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Abcc4E9Q236 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Abcc4E9Q236 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Abcc4E9Q236 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
Abcc4E9Q236 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Abcc4E9Q236 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Abcc4E9Q236 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Abcc4E9Q236 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Abcc4E9Q236 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Abcc4E9Q236 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Abcc4E9Q236 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Abcc4E9Q236 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Abcc4E9Q236 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Abcc4E9Q236 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Abcc4E9Q236 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Abcc4E9Q236 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Abcc4E9Q236 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Abcc4E9Q236 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Abcc4E9Q236 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Abcc4E9Q236 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Abcc4E9Q236 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Abcc4E9Q236 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Abcc4E9Q236 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Abcc4E9Q236 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Abcc4E9Q236 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Abcc4E9Q236 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Abcc4E9Q236 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Abcc4E9Q236 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Abcc4E9Q236 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Abcc4E9Q236 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Abcc4E9Q236 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Abcc4E9Q236 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Abcc4E9Q236 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Abcc4E9Q236 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Abcc4E9Q236 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Abcc4E9Q236 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Abcc4E9Q236 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Abcc4E9Q236 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Abcc4E9Q236 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Abcc4E9Q236 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Abcc4E9Q236 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Abcc4E9Q236 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Abcc4E9Q236 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Abcc4E9Q236 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Abcc4E9Q236 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Abcc4E9Q236 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Abcc4E9Q236 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Abcc4E9Q236 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Abcc4E9Q236 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Abcc4E9Q236 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Abcc4E9Q236 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Abcc4E9Q236 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Abcc4E9Q236 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Abcc4E9Q236 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Abcc4E9Q236 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Abcc4E9Q236 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Abcc4E9Q236 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Abcc4E9Q236 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Abcc4E9Q236 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Abcc4E9Q236 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Abcc4E9Q236 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Abcc4E9Q236 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Abcc4E9Q236 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Abcc4E9Q236 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Abcc4E9Q236 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Abcc4E9Q236 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms