Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1U1

Ccdc171, Coiled-coil domain-containing protein 171, mousemouse

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Length 1,324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc171E9Q1U1 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ccdc171E9Q1U1 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ccdc171E9Q1U1 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ccdc171E9Q1U1 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Ccdc171E9Q1U1 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ccdc171E9Q1U1 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ccdc171E9Q1U1 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Ccdc171E9Q1U1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ccdc171E9Q1U1 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ccdc171E9Q1U1 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ccdc171E9Q1U1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ccdc171E9Q1U1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ccdc171E9Q1U1 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Ccdc171E9Q1U1 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ccdc171E9Q1U1 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Ccdc171E9Q1U1 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ccdc171E9Q1U1 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ccdc171E9Q1U1 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ccdc171E9Q1U1 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ccdc171E9Q1U1 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ccdc171E9Q1U1 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ccdc171E9Q1U1 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ccdc171E9Q1U1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ccdc171E9Q1U1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ccdc171E9Q1U1 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccdc171E9Q1U1 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccdc171E9Q1U1 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccdc171E9Q1U1 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccdc171E9Q1U1 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccdc171E9Q1U1 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccdc171E9Q1U1 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccdc171E9Q1U1 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ccdc171E9Q1U1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ccdc171E9Q1U1 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ccdc171E9Q1U1 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccdc171E9Q1U1 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccdc171E9Q1U1 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccdc171E9Q1U1 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccdc171E9Q1U1 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccdc171E9Q1U1 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccdc171E9Q1U1 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccdc171E9Q1U1 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccdc171E9Q1U1 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccdc171E9Q1U1 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccdc171E9Q1U1 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccdc171E9Q1U1 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccdc171E9Q1U1 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccdc171E9Q1U1 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Ccdc171E9Q1U1 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ccdc171E9Q1U1 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ccdc171E9Q1U1 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ccdc171E9Q1U1 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Ccdc171E9Q1U1 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ccdc171E9Q1U1 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ccdc171E9Q1U1 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Ccdc171E9Q1U1 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ccdc171E9Q1U1 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccdc171E9Q1U1 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccdc171E9Q1U1 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccdc171E9Q1U1 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccdc171E9Q1U1 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccdc171E9Q1U1 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ccdc171E9Q1U1 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ccdc171E9Q1U1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ccdc171E9Q1U1 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ccdc171E9Q1U1 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ccdc171E9Q1U1 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Ccdc171E9Q1U1 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
Ccdc171E9Q1U1 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ccdc171E9Q1U1 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ccdc171E9Q1U1 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ccdc171E9Q1U1 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ccdc171E9Q1U1 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Ccdc171E9Q1U1 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ccdc171E9Q1U1 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ccdc171E9Q1U1 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccdc171E9Q1U1 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccdc171E9Q1U1 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccdc171E9Q1U1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccdc171E9Q1U1 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccdc171E9Q1U1 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccdc171E9Q1U1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccdc171E9Q1U1 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccdc171E9Q1U1 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccdc171E9Q1U1 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccdc171E9Q1U1 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccdc171E9Q1U1 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccdc171E9Q1U1 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccdc171E9Q1U1 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccdc171E9Q1U1 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccdc171E9Q1U1 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccdc171E9Q1U1 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccdc171E9Q1U1 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccdc171E9Q1U1 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Ccdc171E9Q1U1 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Ccdc171E9Q1U1 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Ccdc171E9Q1U1 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ccdc171E9Q1U1 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ccdc171E9Q1U1 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ccdc171E9Q1U1 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
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