Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1J0

Zfp558, Zinc finger protein 558, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp558E9Q1J0 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zfp558E9Q1J0 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zfp558E9Q1J0 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zfp558E9Q1J0 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zfp558E9Q1J0 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zfp558E9Q1J0 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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Zfp558E9Q1J0 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zfp558E9Q1J0 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zfp558E9Q1J0 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zfp558E9Q1J0 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
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Zfp558E9Q1J0 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zfp558E9Q1J0 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
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Zfp558E9Q1J0 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
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Zfp558E9Q1J0 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
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Zfp558E9Q1J0 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Zfp558E9Q1J0 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
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Zfp558E9Q1J0 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Zfp558E9Q1J0 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Zfp558E9Q1J0 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Zfp558E9Q1J0 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Zfp558E9Q1J0 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
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Zfp558E9Q1J0 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
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Zfp558E9Q1J0 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
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Zfp558E9Q1J0 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Zfp558E9Q1J0 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
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Zfp558E9Q1J0 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
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Zfp558E9Q1J0 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
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Zfp558E9Q1J0 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
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Zfp558E9Q1J0 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
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Zfp558E9Q1J0 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
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Zfp558E9Q1J0 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Zfp558E9Q1J0 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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Zfp558E9Q1J0 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Zfp558E9Q1J0 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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Zfp558E9Q1J0 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Zfp558E9Q1J0 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Zfp558E9Q1J0 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Zfp558E9Q1J0 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Zfp558E9Q1J0 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Zfp558E9Q1J0 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Zfp558E9Q1J0 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Zfp558E9Q1J0 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Zfp558E9Q1J0 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Zfp558E9Q1J0 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Zfp558E9Q1J0 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Zfp558E9Q1J0 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Zfp558E9Q1J0 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Zfp558E9Q1J0 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Zfp558E9Q1J0 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Zfp558E9Q1J0 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
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