Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1F5

Myo5c, Myosin VC, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5cE9Q1F5 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Myo5cE9Q1F5 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Myo5cE9Q1F5 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Myo5cE9Q1F5 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Myo5cE9Q1F5 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
Myo5cE9Q1F5 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
Myo5cE9Q1F5 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC30.61■■■□□ 2.49
Myo5cE9Q1F5 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Myo5cE9Q1F5 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Myo5cE9Q1F5 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Myo5cE9Q1F5 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Myo5cE9Q1F5 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
Myo5cE9Q1F5 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Myo5cE9Q1F5 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Myo5cE9Q1F5 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
Myo5cE9Q1F5 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Myo5cE9Q1F5 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Myo5cE9Q1F5 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Myo5cE9Q1F5 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Myo5cE9Q1F5 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Myo5cE9Q1F5 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Myo5cE9Q1F5 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
Myo5cE9Q1F5 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
Myo5cE9Q1F5 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
Myo5cE9Q1F5 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
Myo5cE9Q1F5 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Myo5cE9Q1F5 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
Myo5cE9Q1F5 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
Myo5cE9Q1F5 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Myo5cE9Q1F5 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Myo5cE9Q1F5 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
Myo5cE9Q1F5 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Myo5cE9Q1F5 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
Myo5cE9Q1F5 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
Myo5cE9Q1F5 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Myo5cE9Q1F5 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Myo5cE9Q1F5 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
Myo5cE9Q1F5 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Myo5cE9Q1F5 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
Myo5cE9Q1F5 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Myo5cE9Q1F5 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC30.57■■■□□ 2.48
Myo5cE9Q1F5 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Myo5cE9Q1F5 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Myo5cE9Q1F5 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Myo5cE9Q1F5 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
Myo5cE9Q1F5 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
Myo5cE9Q1F5 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Myo5cE9Q1F5 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
Myo5cE9Q1F5 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Myo5cE9Q1F5 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Myo5cE9Q1F5 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Myo5cE9Q1F5 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Myo5cE9Q1F5 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Myo5cE9Q1F5 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Myo5cE9Q1F5 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Myo5cE9Q1F5 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Myo5cE9Q1F5 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
Myo5cE9Q1F5 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Myo5cE9Q1F5 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Myo5cE9Q1F5 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Myo5cE9Q1F5 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Myo5cE9Q1F5 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
Myo5cE9Q1F5 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Myo5cE9Q1F5 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.47
Myo5cE9Q1F5 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Myo5cE9Q1F5 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Myo5cE9Q1F5 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Myo5cE9Q1F5 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Myo5cE9Q1F5 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Myo5cE9Q1F5 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Myo5cE9Q1F5 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Myo5cE9Q1F5 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Myo5cE9Q1F5 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Myo5cE9Q1F5 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Myo5cE9Q1F5 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Myo5cE9Q1F5 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Myo5cE9Q1F5 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
Myo5cE9Q1F5 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Myo5cE9Q1F5 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Myo5cE9Q1F5 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Myo5cE9Q1F5 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Myo5cE9Q1F5 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
Myo5cE9Q1F5 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Myo5cE9Q1F5 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Myo5cE9Q1F5 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Myo5cE9Q1F5 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
Myo5cE9Q1F5 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Myo5cE9Q1F5 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Myo5cE9Q1F5 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
Myo5cE9Q1F5 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Myo5cE9Q1F5 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Myo5cE9Q1F5 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Myo5cE9Q1F5 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Myo5cE9Q1F5 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.47
Myo5cE9Q1F5 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
Myo5cE9Q1F5 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
Myo5cE9Q1F5 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Myo5cE9Q1F5 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Myo5cE9Q1F5 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Myo5cE9Q1F5 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
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